不管是防病还是治病的用药，都要遵循一定的原则和方法进行，否则将会适得其反。
（1）必须掌握作为用药对象黄鳝的生物学特性与生态习性。根据对象施用药物是用药的基本原则，对于过去养过鱼现在养鳝的经营者尤为重要，因为常规养殖鱼与黄鳝在习性方面有很多不同之处。如防治草鱼病时只需将药物混入饲料制成药饵，草鱼就能较好的摄取，而黄鳝的药饵必须添加引诱物（如蚯蚓等）才能使之摄取。
（2）必须掌握一定的药物知识。与防治鱼病的药物一样，防治鳝病的药物有各自的性质。因此，施用药物时要注意药物的相互作用，注意药物配伍的禁忌性。如施用硫酸铜时不施用漂白粉。
（3）必须对疾病进行正确的诊断。只有正确诊断疾病，才能做到对症下药。如在治疗寄生虫疾病与细菌性疾病等方面的用药完全不同，前者多用杀虫剂，后者多用抗生素等药物。
（4）必须掌握影响药物作用的因素。影响药物作用的因素较多，主要有环境因素（温度、pH、水中有机物等）、化学因素（如漂白粉会因吸潮而失效、生石灰是块状的“管灰”而不是粉状的“化灰”）、药物因素（如一些药物必须内服，另一些药物必须外用）等。