在父亲的亲自指导下，李时珍开始正式行医。初涉医坛的李时珍激动万分，因为他继承父业，为自姓解除疾苦，为他人治病延寿的愿望，终于得以实现了。
李时珍深深懂得，当郎中治病救人这副担子的沉重。所以，他小心翼翼地随父行医，认真观察每一个病例，记下每一例病史，从形体、外观、容颜、舌苦到脉象。
诊断、用药以至疗效都做了详细的记录。因为他知道，这是父亲几十年行医的经验，是无数前人行医心血的总结。
李时珍不仅重视行医实践，更加重视系统地学习、研究先人的医药论述，并努力把两者结合起来，用医药学理论指导医疗实践，用医疗实践的认识去验证医药学理论。
这时，李时珍已经有了一个儿子，名叫李建中。在行医中，李时珍同时帮助父亲挑起养活全家的生活重担。
俗话说：“挑重担子的人走得快。”李时珍两副担子一起挑，开始经受事业、生活两方面的考验。
就在李时珍正式行医不久，南方连年受灾，不是旱，就是涝。
蕲州是连年受灾的地区之一。旱灾时，河流量锐减，大河少水，小河无水，一些水渠和池塘完全干涸了。旱情严重，土地干裂，田里的秧苗全部干枯了，颗粒不收，农民陷人困苦之中。农业的歉收，也亘接影响到其他行业，到处呈现一派衰落的景象。
水灾时，阴雨连绵，雨量猛增，河水暴涨，泛滥成灾。农田被淹，屋舍倒塌，牲畜被溺，百姓无家可归，只得流落他乡，以求生存。
而且往往是祸不单行，灾年又有瘟疫流行，受苦受难的百姓怎能经受得住这样的折磨呢？面对着天灾人祸，有谁来帮助这些受苦受难的人们呢？
依照明朝的官制，明朝政府设有专门医治病人的单位，叫医药惠民局，惠民就是给百姓以好处。
但是，当时的统治阶级根本不管百姓的疾苦，惠民只是挂出来贴金的招牌，骗人的幌子，笼络人心的话语。
那些身处医药惠民局的官员，一味以职谋利，贪赃枉法、营私舞弊。他们还借用买卖药材的机会，低价收购，高价售出，以次充好，以假充真。
这些医官们们天天净想的是坑人、害人、捞钱，哪里还有什么恩惠给贫苦的百姓呢！
在灾荒、瘟疫笼罩下的百姓，有许多人在饥饿和病痛的折磨下，凄惨地死去。勉强活着的穷苦百姓，无力地在死亡线上挣扎。
严重的灾害，众多的病人，使得李时珍父子全力以赴，夜以继日地为病人工作。
李时珍从早忙到晚，帮助父亲医治一批又一批病人。病人太多了，忙得他连吃饭的工夫都没有。
有时为了抢救危重病人，他们还得走上十几里甚至几十里路去出诊，力图尽量把病人从死亡线上抢救回来。
对待穷苦百姓，李时珍总是细致地诊治，精心地开药，耐心地解释。有时登门看病、送药，对危重病人日夜监护。
当时蕲州一带患血吸虫病的人很多。那时，人们管这种病叫做膨胀病、这种病难治，更难治愈，历来都使医生们感到头痛。
血吸虫病是千百年以来我国南方常见的、广为流行的寄生虫病。南方的水域多，到处有河流、湖泊、池塘，农田多为水田。农民、渔民常在水中作业。
因此，生长在水中的血吸虫有非常多的机会侵入人体。南方人爱吃田螺，血吸虫就潜入某些田螺体内，人们吃了带有血吸虫的田螺，染上血吸虫病是很容易的。
蕲州一带遭受水灾后，人们与疫水接触的机会加大，得膨胀病的人数猛增，这可使当地的医生们为难了，恰逢此时，李时珍初涉医坛，这可是一场医德、医技的考验啊！
在困难面前，李时珍是从不回避的。他认真地学习了《外台秘要》一书，对医治膨胀病有关的知识进行了反复地、深入地研究，掌握了这种病的病源、病理及治疗方法。
在父亲的指导下，李时珍结合具体的病例与医书对照，认真地观察研究、治疗每一位患者。
起初，李言闻每诊完一位病人后，都让李时珍重诊一次，然后让李时珍先讲讲诊断结果。
李时珍略沉思下说道：“据病人自已说，感到肚子胀，浑身无力，纳食不佳，症状已有半年多了……”
听着儿子有条不紊的陈述，父亲一边微笑一边点头说：“你的诊断是正确的。你看，这位病人腹胀过甚，两腿奇肿，是位典型的膨胀病患者。”
李言闻为儿子的进步感到由衷地高兴。
“那么，该开些什么药呢？”李言闻问儿子。
“苍术3钱，当归3钱……”
听完儿子的诊断，李言闻十分满意，同意他的诊断，用药，并不失时机地诱导儿子说：“一定记住，熟读王叔和，不如临症多。”
“是的，孩儿明白。”
王叔和是晋代写《脉经》的著名医学家，李言间用这句医界谚语鼓励儿子多参加医疗实践活动，李时珍也乐于在实践中增加感性知识，积累经验，提高医疗水平。
李家父子就这样一面抢救病人，一面不断学习，不断切磋，根据病人的具体情况，加药、减药、改药方……
就这样，李家父子先后给100多位膨胀病患者治了病。
处在灾年这样的非常时期，收取药费也只能视情况而定，能给的就给，给不足的，只好能拿出多少是多少，如果根本拿不出钱，那也没有办法，只能算了。
有时，李家还留病人在家吃饭，甚至还让病人带走些干粮。李家父子真正做到了治病救人，乐善好施。
由于李家父子的全力抢救和精心医治，不少危重病人都恢复了健康。他们的医术、医德、善行传到四面八方，百姓们由衷地称赞李家父子。
在救灾治病的过程中，在行医的实践中，李时珍得到了锻炼，增长了知识，积累了经验，提高了水平，他所追求的目标开始实现了。
李时珍初涉医坛就已经对人民，对社会做出贡献，他的医术、医德，名传四方了，前来请他治病的人越来越多。