为改变蚂蚁千百年来弱小被欺的历史，西双版纳热带雨林里的蚂蚁国开展了史无前例的全盘人类化运动。出类拔萃的小蚂蚁丁点儿被蚂蚁女王黑格格派往人类社会执行最伟大的任务：偷取人类能把动物变成人的神奇宝贝——基因转换技术。
在寻找基因转换技术的过程中，（丁点儿变身的傣族小孩）“艾射”遭遇了身份暴露、惊马撞车、小象报复、被人绑架等险情，几度命悬一线。危难之时，“艾射”发现自己拥有蚂蚁力大无比的基因潜能，再运用黑格格女王传授的“万物咒”和自己的聪明头脑，他一次次化险为夷，转危为安。在人类社会，单纯的“艾射”不仅善待他人，而且最容忍不了恃强凌弱的行为，他一次次出手惩罚欺负弱者的人，因此得到人类同学以及牧羊犬阿波罗的认可和喜爱。此时，女王交办的任务也有了突破性进展。眼看弱小的蚂蚁可以变成——世界上最强大的人，“艾射”高兴万分！然而，蚂蚁国的一场内乱，让他惊讶地发现，蚂蚁国全盘人类化的实现必须以毁灭整个人类为代价。“艾射”陷入深深矛盾与痛苦之中！在人间的种种境遇，早让他改变了对人类不好的看法，并喜欢上了人类；银杏爷爷醍醐灌顶的话更让他认识到生命的可贵；痛恨杀戳的“艾射”终于做出惊人选择——自毁！也不做伤害无辜生命的帮凶！！
丁点儿在人间的行动早在人类的监视之下，他自毁的念头震憾了波艾射和基因科学家高明博士，也挽救了他和蚂蚁父母的生命。
《蚂蚁密探丁点儿》运用逆向思维，借各种动物植物的视角，反映人类的不足和长处。同时，将丰富的蚂蚁知识、傣族风土人情，做人的道理等自然地融入到曲折有趣、悬念迭起的故事内容中，让孩子们从幽默生动的讲述中审视了解人类，掌握大量有益的知识，并深深领会到：关爱保护弱者，尊重珍惜世间生命，万物和谐共生才是地球生命最好的选择。