以绿色食品猪肉为例，绿色食品"全程质量控制"的主要环节包括：
（1）饲料中主要原料成分如玉米、豆粕等要达到绿色食品质量标准要求；玉米、大豆基地环境（大气、土壤和灌溉用水）要通过环境监测，并符合绿色食品产地环境质量要求；玉米、大豆种植过程中投入品（农药、肥料）的使用要严格控制，并符合绿色食品农药、肥料使用准则的要求。
（2）对饲料添加剂进行严格控制。如禁止使用任何药物性饲料添加剂、禁止使用激素类、安眠镇静类药品。饲料添加剂使用种类和方法要符合绿色食品饲料添加剂要求。
（3）对饲料加工应制定严格的管理制度，包括原料仓储、饲料加工、成品包装及仓储、与普通饲料区别管理体系。
（4）要求生产者供给动物充足的营养，提供良好的饲养环境，加强饲养管理，增强动物自身抗病力，生猪疾病以预防为主，建立严格的动物安全体系和生产记录制度。如饲养中必须使用兽药时，可以使用绿色食品允许使用的抗寄生虫药和抗菌药，但应严格遵守规定的作用与用途、使用对象、使用途径、使用剂量、疗程和注意事项。
（5）原则上要求有专用的绿色食品生猪屠宰、分割、冷藏车间，其卫生管理要符合绿色食品动物卫生准则的有关要求：要求建立严格的检验制度（如胴体检验、寄生虫检验）；屠宰厂、分割车间用水应符合绿色食品加工用水质量要求。
（6）猪肉产品质量应通过绿色食品定点产品监测机构，符合绿色食品猪肉产品质量要求。
（7）猪肉产品包装、运输和仓储要符合绿色食品相应标准和规范要求。