11世纪，经院哲学在教父哲学的基础上形成。这是基督教理论化系统化的第二个高潮。经院哲学的根本任务是为基督教的教义和教条作论证，使其系统化哲学化。经院哲学分两个阶段。第一个时期是准备形成时期。出现了唯名论与唯实论的争论。第二个时期出现了托马斯主义和反托马斯主义的思潮。
唯名论与唯实论的论争（这是经院哲学在其内部产生的两种思潮），他们争论的问题是“一般”是实在的，还是“个别”是实在的。“一般”是指一类事物形成类事物的概念，“个别”是指具体事物。一般和个别哪一个是实在的（真实存在的），这个问题包含着对其基督教思想——上帝存在的一个论证。
唯名论者认为，真实存在的只有个别没有一般，一般仅仅是人们用来表述事物的名称和概念的。唯名论有两种形式。极端唯名论和概念论。
极端唯名论认为不仅客观上不存在一般，就是人们的思想上也没有一般的概念。所谓一般只是一个名词，或者说只是一种声音。在他们看来，一般的概念和具体的事物的关系是偶然的，而不是必然的，即桌子与真实的个别的桌子之间只存在起名的偶然性。把一般名词化，把一般和个别关系偶然化，这就是一种极端的唯名论思想，代表人物是罗瑟林（神学家）。
概念论认为一般不单是个词，也是人心中的概念。它概括了一类事物的共同特征。因此，这个一般是个概念，它和具体事物的关系是必然的，而不是偶然的。
唯实论认为，概念概括了事物的基本特征，它是能够成为决定具体事物的东西。一般（概念）先于个别事物而存在，是独立于个别事物的客观实在。真实存在的是一般（概念），而不是个别。如：具体桌子是不真实的，因为它们形态各异，各种各样，不断变化，我们的思想无法把握，但那个一般的桌子的概念是不动的，它概括了所有桌子的共同特征，是真实的，它是我们思想能够把握的东西。而个别事物正因为无法把握，所以是不真实的，神学观点认为：一般（概念）是上帝创造事物的一个原型（依照一般创造具体事物）。
经院哲学的发展在早期论争了几百年，后人怎样评价这个论争呢？其实，人们认为他们的论争是其内部两股哲学思潮的论争——唯物主义与唯心主义的论争。
下面介绍一位重要的经院哲学家的思想，他就是实在论的著名代表人物安瑟伦。
安瑟伦（1033-1109年），意大利人，基督教经院哲学家，神学家。唯实论的主要代表人物。二十六岁进入本笃修会，先后任法国柏克隐修院副院长、院长，英国坎特伯雷大主教。大主教任内曾因主教续任权与英王争执，两次遭驱逐。他认为信仰高于理性，是理性的基础，提出了关于上帝存在的本体论论证，即上帝是最完美者，而不存在者不是最完美者，故上帝必然存在，为上帝和教会高于一切作了哲学论证。有最后一位教父和第一位经院哲学家之称。
首先，他提出了信仰高于理性，理性服从信仰的基本原则。他说，上帝把理性交给信仰使唤，人们不能先理解再去信仰，而是先信仰然后再去理解。在神学发展史上，他最著名的是关于上帝存在的证明。这个证明，体现了基督教神学哲学化最典型的特征。基督教是宗教，是神学，神的存在是靠信仰支持的。上帝是否存在，只能靠信仰。一些神学家用哲学的方法去证明上帝的存在，最著名的两个人是安瑟伦和托马斯。我们来看他们是怎样证明上帝存在的。
安瑟伦说，每个人的心中都是有上帝观念的。一种人承认有上帝存在，另一种人不承认有上帝存在，不承认有上帝存在的人，但他的头脑中也有上帝的观念。当你说没有上帝的时候，其实有一个上帝，你已经用来否认它了，所以，所有人心中都有上帝的观念。因此，上帝的存在是一个自明的、必然的真理，否认上帝的存在必然导致逻辑上的自相矛盾，因而证明上帝的存在不需要借助有限的经验事实，只需要借助先验的逻辑力量，仅仅从概念就可以推演出上帝的存在，这就是所谓的“本体论证明”。
在安瑟伦看来，即使是不信上帝的“愚人”，在心里也有一个上帝的观念，亦即一个“可设想的无与伦比的伟大的存在者”，既然如此，“还有一个不可设想的无与伦比的伟大的东西，它不能仅仅在心中存在，因为，即使它仅仅在心中存在，但是它还可能被设想为也在实际上存在，那就更伟大了。”这就是说，如果这个“无与伦比的伟大存在者”仅仅是“可设想的”即在思想之中，那就不是“无与伦比”的了。因为不仅在思想中也在实际上存在比它更“无与伦比”也更伟大。但我思想中的上帝观念的确是无与伦比的，所以认为“一个无与伦比的伟大存在者”仅仅存在于思想中，肯定是自相矛盾的。换言之，只要你心中有一个无与伦比的伟大存在者即上帝的观念，它就不可能不包括存在的性质，因而，一定也在现实中存在。有上帝的观念，就意味着上帝存在——上帝意味着绝对的完善，因此。它就不可能仅仅存在于人们的心中，也存在于现实当中，这体现了实在论的基本观点。
本体论的证明，属启示神学，它从观念出发，把观念作为一般，它不仅存在于人们的心中，也存在于现实当中。