巫山古城遗址位于巫山县巫峡镇神女居委，位于长江北岸，1997年、2000年、2003年、2006年该遗址由中科院考古研究所、重庆市考古所、武汉市文物考古所对其进行了全面发掘，遗址分布面积20000平方米，发掘面积共10015平方米。该遗址文化层深度0.5-8.5米。发掘城墙墙体及汉、宋、元、明时期的砖室墓和土坑墓等遗迹多处。出土器物1328件及大量东周时期陶片，包括玉、石、骨、象牙、陶、金、铜、鎏金、瓷器等。该遗址共包含了四个大的区域：人民医院旧址区域、城南门点、城关粮站旧址区域、巫山师范区域。其中人民医院旧址以大溪文化为主，出土了1千多件文物和鱼骨坑等遗迹，巫师区域发现了较完整的西汉时期巫山古城墙。从众多汉代文物标本和文化遗存表明，巫山是三峡地区一个著名的文物重镇，对研究大溪文化时期分布范围及各时期文化发展提供了较重要的依据。
