崇福寺又称崇福院，位于福州市新店象峰南麓，为福州五大禅寺之一。始建于宋太平兴国二年（公元977年），后废。明万历四十七年（1619年）跬存和尚在该院旧址创建“养母堂”，辟地基时发现“崇福禅院”石额，遂发愿重兴，最初仅建小屋3间。崇祯五年（1632年）在鼓山涌泉寺永觉禅师赞助下募缘续建大殿、法堂。清康熙三十三年（1694年）扩建，后逐渐发展，梵宫林立，殿宇巍峨。现存旧建筑多为清光绪廿一年（1895年）冬由鼓山涌泉寺住持古月和尚募缘重建的。
1949年后，寺僧二十多人参加土改，分到一部分田地，诵经坐禅之余，以耕田自养。1957年福州市佛教协会在寺中创设佛教安养院，安置老弱贫病的佛教徒数十人。1966年“文革”爆发，寺院遭破坏，后又被华侨农场占用。不久怡山西禅寺部分年老僧人亦徒置于寺中，随着党的各项宗教政策的落实，崇福寺得以恢复，并成为尼众道场。由于传常法师的惨淡经营，至1983年陆续重修了各殿堂并重塑多尊佛像。是年春，福建佛学院女众班设于该寺，如今的崇福寺，占地面积3816平方米，拥有天王殿、大雄宝殿、法堂、齐堂、地藏殿、伽蓝殿等18座殿堂， 1992年被列为市级文物保护单位。
日本长崎市也有一个崇福寺，寺在长崎圣寿山下，创建于公元1635年（明崇祯八年），第一代主持僧超然，是从福州去的。当明末清初之际，福州人避居长崎的特别多，他们在那里安家落户，每年有一天“庙会”，在崇福寺聚会，认乡亲，相沿成俗，所以日本长崎的崇福寺又叫福州寺。
福州崇福寺和长崎崇福寺关系密切，现在福州市与长崎市又结成了友好城市，这是中日两国人民友谊的象征。