苦荞收获后用手工或脱粒机将苦荞籽粒从植株上脱下来，晾晒、收集、储存。苦荞加工前首先要对籽粒进行清理，这是保证食品安全的第一环节，也是保证苦荞产品品质的基础。
一、清理的目的
苦荞加工的前处理就是将混于苦荞籽粒中的各种杂质清理去除。苦荞麦成熟后，在收割、晾晒、脱粒、运输、转运、储藏过程中往往会混进许多杂质，如枯叶、柴草、草籽、秸秆碎段、土块、石子、虫卵、铁钉、尘土等，这些杂质的存在不仅对后续加工造成麻烦，如损坏设备、加速磨损机器部件，还会对食品的安全造成极大隐患。另外经过一段时间储存，还会出现虫蚀粒、霉变粒、鼠类侵害、鸟粪等。
清理的目的就是要从苦荞籽粒中彻底去除这些杂质。清除各类无机杂质（枯叶、柴草、草籽、秸秆碎段、土块、石子、虫卵、尘土等）、矿物杂质（铁块、煤渣、金属物等）、有机杂质（生芽粒、虫卵、病虫粒、霉变粒、鼠屎、鸟粪等），使苦荞籽粒在加工前达到《荞麦》国家标准ＧＢ１０４５８８９所要求的质量指标，见附录。这样才能保证苦荞籽粒后续加工的产品食用安全，符合食品安全标准，也不至于由于矿物杂质混入使机器设备遭受损坏。
苦荞加工前的清理绝非可有可无，这一关一定要把好，要充分重视，有切实可行的手段，做到尽量将各类杂质去除干净。这不仅是关乎产品品质、口感、味觉等直观质量，更重要的是关乎食品安全和消费者健康的大事。
二、清理的基本方式
苦荞清理是根据苦荞的种植方式和生产规模，采用人工清理或机械清理。
对于拾遗补缺、灾后补种、小地块零星种植的农户或小规模苦荞加工户常常是手工清理。首先用大孔筛子将大于苦荞籽粒的杂质筛除，再用小孔筛将小于苦荞籽粒的小杂质筛除，然后用箩或簸箕人工筛簸，让轻质杂质飞飘出去，接着进行水洗将土块溶解将不饱满粒漂浮取出，排掉水，晾干清洁的籽粒，以备加工。这种清理方式清理有一定缺陷，对于和苦荞籽粒大小相当的杂质如氧化铁块、石子、草籽等清除不掉，筛簸过程因个人的手法不同、精心程度不同筛选效果会有很大差别，并且还要耗费清水，占用人力，效率低下。
机械清理就是用粮食加工的各种清理设备去除苦荞籽粒中的杂质，苦荞主要清理机械有振动清理筛（图５１）、吸式比重去石机（图５２）、旋风除尘系统（图５３）、除铁器、抛光机等。
１振动清理筛是常用的除杂设备，由两层筛网组成，上层为大于苦荞籽粒的钢板网并且有筛网的前后过度以利物料流动，下层为小于成熟苦荞籽粒的钢板网，通过振动电机形成抛物震动，物料抖动着从筛子进料口走向出料口，在这一过程中大于和小于苦荞籽粒的杂质被分离去除，在筛子出口处有一吸风道，来自于旋风除尘系统的负压将和苦荞籽粒大小相当的轻质杂质和尘土抽走。
２吸式比重去石机机箱底部是鱼鳞状钢板网，当物料从进料口进入去石机机体内，苦荞籽粒在电机振源的抛物震动和来自于旋风除尘系统的负压抽吸下，悬浮着流向出料口，在这个过程中，与苦荞籽粒大小相等的土块、石块由于和苦荞籽粒比重不同而向斜上方爬动，最终从机体前部的出石口排出。
３旋风除尘系统旋风除尘系统由旋风除尘器、低压鼓风机、闭风器和风网管道组成。被吸起的轻质杂质和灰尘从旋风除尘器的进风管道进入除尘器内腔，由于容积突然增大，风速度降低，这些轻质杂质和灰尘顺着腔内涡旋向下降落积聚在底部，并从旋转阀式的闭风器底口排出机体外部。
４除铁器除铁器的功能是将混于苦荞籽粒中的铁性杂质去除掉，保护后续加工的设备安全和食品干净。
５抛光机抛光机的作用是将苦荞籽粒经过机械擦拭去掉黏附在外壳表面的尘土杂质。
机械清理苦荞籽粒，去除杂质干净，无人为干扰，效率高，是食品生产企业清理粮食原料常用的措施。
三、清理加工线
有些设备生产厂家将杂粮清理的各种设备制作成机组形式（图５４），多种功能同时实现。组合清理机原理是：苦荞原粮先提升到机组顶部进入简易振动筛，将大、小杂质分离，接着落入下面的去石装置进行清理去石，去石之后，物料接着落进下面的风箱以吹走轻质杂质。清理后的苦荞籽粒从机组最底层的螺旋输送机排出机外。
这种方式清理综合功能强，但不精细，振动筛前端没有吸风道，灰尘容易外溢，去石机采用底吹悬浮物料会使尘土飞扬，底部风箱吸尘从原理上不如吸风道。总之，清理效果受到一定限制。
清理加工线是由独立的粮食清理设备通过工艺组合成苦荞清理加工系统（图５５）。由振动清理筛、吸式比重去石机、输送设备、支撑平台和旋风除尘风网系统等组成，苦荞原粮先提升输送到平台上的振动清理筛进料口进行去杂清理，并在振动清理筛前端的吸风道抽走轻质杂质，然后落入平台下面的吸式比重去石机进行去石操作，净粮则从去石机出粮口流出。整个过程自动实现，旋风除尘系统既给吸风道提供风力，又给去石机提供物料悬浮负压，物料在封闭系统中流通，吸附的灰尘杂质都从旋风除尘器底端的闭风器下口排出。
图５６是具有除铁抛光功能的苦荞清理加工线工艺设备示意图，这种清理线清理的苦荞籽粒较为干净，杂质去除较为彻底，清理效率较高，现场清洁，无粉尘，在目前技术设备条件下是较为理想的清理方式。苦荞初级产品加工企业、苦荞食品规模生产企业大都采用这种原粮清理方式。
图５６具有除铁抛光功能的苦荞清理加工线工艺设备示意图苦荞清理生产线见图５７。