对患病林蛙解剖对确诊多种疾病有重要的作用，特别是对外伤、消化道疾病、肿瘤有重要意义，许多传染病可以从内脏器官的变化上辨认出来。
解剖病蛙要及早进行，对于死亡较久或发生腐败的林蛙，病变组织已经发生变化，难以反映真实情况，最好剖检临死林蛙或刚死林蛙，对疑似传染性蛙病，为防止其继续流行，应及早处死，症状明显的病蛙要尽早诊断。
解剖病蛙，首先是沿腹中线，剪开皮肤，蛙皮肤与肌肉容易分开，先观察肌肉是否出血，淋巴间隙是否有沉淀，观察肌肉是否被胆汁黄染，然后沿肛门向前剪开肌肉直至胸骨处，再从胸骨右侧剪开胸腔，使内脏器官充分暴露，逐个检查各器官系统的病变，很多疾病的病变是有价值的。例如，传染性肝病，胃肠道多数有较多黏液，肝脏出血或肿大坏死。肿腿病的病蛙其患肢肌肉严重出血或溃烂。如要检查胃肠道寄生虫，可将胃和肠道剪下，放在一玻璃皿或大容器中，小皿内盛上清水，并将此小皿放在黑纸上，将胃肠道用小剪剪开，消化道的寄生虫会逃出到清水中，易于检查。