乡村生态旅游的开发必须追求开发与环境保护、商业利益与生态效益的平衡。
从乡村生态旅游产生的思想渊源来看，在生态危机、大众旅游造成的负面影响的推动下，以人类中心主义为主导的环境伦理思想开始发生变化，可持续发展的观念得到确立。在生态中心主义伦理学的影响下，乡村生态旅游的规划者、经营者和旅游者之间，逐步产生了尊重自然、尊重当地人意愿的态度，使得乡村生态旅游的开发具有了明显的生态思想。
从乡村生态旅游赖以开展的旅游设施来看，原始的乡土物种、多样性的生态系统、相对完整的乡土文化、清洁的乡村环境、保持水土的生态工程、富有科技含量的生态农业园区等，无不体现出乡村环境生态化的特征。
从乡村生态旅游经营管理的软件设施来看，安排细致及有深度的生态旅游套餐行程，如认识药用植物、原生植物、鸟类、蝴蝶、蛙类、蔬菜专业区、葡萄园及酒庄、花卉专业区、养蜂事业、香菇栽培、茶叶产销、竹林产销、荔枝或芒果产销的学习、观摩等，都贯穿着生态知识，让旅游者、经营者能更好地了解乡村环境、融入乡村环境，从而更好地保护它。
从游客的行动来看，乡村生态旅游者身体力行于乡村生态旅游地的环保，在体验农业劳动、农村民俗的过程中获得对乡村自然环境和人文环境的深度了解，通过经营者教育、旅游规范的约束，逐渐形成正确的旅游环境保护行为，使旅游活动更具有生态旅游的特征。