秋季气候开始转冷，日照也逐渐变短，气温对藏獒非常适宜。生性喜欢凉爽和寒冷的藏獒解除了炎热的束缚，在秋高气爽的季节里显得格外神情欢畅。此时，藏獒身心健康，食欲好，食量大，体质体况迅速恢复，一反夏天的懒态，在场院里互相追逐，相互舔吮，性机能已开始活动。这个阶段对藏獒日常管理的重点包括以下几个方面：
（1）及时进行秋季防疫工作。秋季气温开始下降，气候多变，必须对所有藏獒进行免疫接种。首先，要对所有犬只普遍进行一次卫生检查，记录检查结果；对患病犬及时诊治，重症病犬酌情处理或隔离。在确定场内无病犬后，才开始实施免疫，接种犬五联或六联弱毒疫苗等。然后，对全场藏獒用左旋咪唑或丙硫咪唑进行驱虫。
免疫接种和驱虫一定要在秋季藏獒开始发情前完成，以免犬只在发情配种后因注射和投药引起不良反应，影响犬的正常发情或干扰正常的妊娠过程。
（2）及时提高日粮的营养标准。夏末秋初，为应对气候转凉，藏獒食欲旺盛，食量增加，开始为安全度过漫长的冬季贮积脂肪，也为即将开始的发情配种做好准备。食料中除注意各种营养成分的完善与平衡外，还可增加适量的新鲜蔬菜，这样既可以让藏獒吃饱，又不至于过肥而影响繁殖。应注意给公、母獒补充钙、磷等矿物质元素和维生素E、维生素A和复合维生素B等物质，可有效促进藏獒性细胞的发育和成熟。
为保证老龄犬的繁殖能力，应当在母獒发情前1个月或更早就给母獒投服刺激卵泡发育的药物，例如溴隐亭等。此类药物可促进卵巢活动和卵泡发育，有利于提高老龄犬的排卵量，调动其生殖机能。为了不影响公獒的精液品质和母獒的排卵量，在给繁殖公、母獒驱虫时不要用阿维菌素类药物。
（3）不误时机，抓好配种。此时对繁殖适龄的公、母獒，除加强营养和运动外，还应定时将处于发情冲动中的公、母獒放出栏外，任其互相追逐嬉戏，不仅能增进犬只之间的关系，有效地促进母獒正常发情，防止出现“看不上”而拒绝交配或交配失败；而且可增强公、母獒的体质，提高公獒精液的品质。
9月份以后，体况健康、膘情适宜的经产母獒已经开始发情。9~11月份，几乎所有的藏獒都进入了发情期。此时的工作重点是崽细观察，了解每只母獒的发情表现和发情状态，准确掌握配种的最佳时机，及时配种，为翌年生产和推进藏獒的选育工作奠定基础。