祖国传统医学认为，荞麦有平血健脑的功效。荞麦中的苦味素有清热败火健脑的作用。所以荞麦不仅营养丰富，而且有极高的药用价值。
苦荞是提取芦丁的主要原料之一。荞麦的芦丁含量是其他粮食作物所不具备的。甜荞的芦丁含量一般在0.02％～0.798％，苦荞在1.08％～6.6％。芦丁用于治疗毛细血管脆弱引起的出血病，并用作高血压的辅助治疗剂。
近代医学表明，荞麦中的芦丁是黄酮类复合物，具有多方面的生理活性，几乎对所有的中老年心脑血管疾病有预防作用和辅助疗效，而且具有一定的抗癌作用。
苦荞中的苦味素有清凉解毒、消炎的作用。由果胶和黏质组成的食物纤维对治疗和缓解糖尿病、高血脂等疾病有积极的作用。荞麦中所含无机元素，如钙、磷、铁、铜、锌和微量元素硒、硼、碘、镍、钴等，对人体的组织功能和生理代谢都有良好的作用。长期食用荞麦，体内的必需元素含量会提高，这对肝肾的保护、造血功能的增强和免疫力的增强有极大的作用，有益于提高智力，保持心脑血管正常，降低胆固醇。
荞麦中富含其他作物所缺乏的硒。人体吸收足够量的硒有利于防癌。荞麦籽粒中的胱氨酸和半胱氨酸，具有较高的放射性保护特性。荞麦在防病治病中有良好的药用价值，以食代药既经济安全，又可改善生活，强身健体。我国现代医学对荞麦特别是对苦荞麦的研究与利用居世界领先地位。