马尔济斯最重要的幼犬训练就是上厕所，马尔济斯天生是很爱清洁的动物，一般不会把粪便溺在住处。幼犬出生一个月后就会有自动离开住处去寻找排便地方的意识。从幼狗拿到家之日起，便要用心地训练它上厕所。
在训练马尔济斯犬时，您必须建立“处罚是用以纠正不适当行为”的观念。过去几年来，“处罚”几乎成了一项禁忌。很人多误以为处罚是残忍的，甚至是无用的训练工具。事实上，处罚只要运用的方式及时正确，对于禁止幼犬做某一项行为是相当有效的。传统的处罚，通常都在幼犬犯错很久后，由着饲主的心情随意施之。这种老式的处罚方式与其说是训练，还不如说是在报复幼犬不听话。
完全正面奖励的方式来训练小狗的人固然是相当可敬，但懂得正确运用处罚，达成训练目标的人更是可佩。在训练不成的沮丧状态下，大多数主人会采取老式的处罚方式，如打幼犬屁股。讽刺的是，虽然社会风气已转变，大家已不再采用传统的处罚方式，但虐待动物的例子却有增无减。要破除这种矛盾，就得重新思考我们对“处罚”所持的道德观，以及如何正确运用此一有力的训练方法。我们通常认为道德高尚的人绝不会施加痛苦于自己的宠物犬身上。但此一论点在理论上是很好，在实际上却不可能。就以带小狗看兽医做例子吧。我们让兽医为小狗打针、抽血、粗鲁地摸来摸去；等到小狗够大了，甚至可能要它挨上一刀，做结扎手术。如果我们还坚持“不让小狗受到痛苦”，那实在是一种伪善。我们会为了健康上的理由让爱犬不舒服甚至痛苦；却不愿意为了训练上的要求来处罚爱犬。要改变这种偏见，我们必须修正我们的道德观，要以“不对犬造成伤害”为原则，而非伪善坚持“不对爱犬造成痛苦”。