十一月，西捻军从宜川壶口渡过黄河，至山西吉州，刘松山、郭宝昌两军尾追过河。
十二月，左从临潼率5000人东向，至潼关。
同治七年（1868年），五十六岁
正月，抵山西介休，出井陉，自河北正定至保定。西捻军逼近京郊卢沟桥。
二月，西捻军在冀中饶阳、深州地区往返游动作战，左督诸军自祁州分道南下。
五月，左军在海丰、吴桥击败西捻军
六月二十八日（8月16日），西捻军覆没。梁王张宗禹突围至徒骇河边，不知所终。左晋升太子太保衔。
八月，左至北京“入觐”。
十月，至西安。
同治九年（1870年），五十八岁
二月，周夫人卒于家。
五月，“天津教案”发生，左主张加强海防，防患于未然。
同治十年（1871年），五十九岁
正月，刘锦棠将马化龙及其家属部下1800余人处死。清廷加左一等骑都尉世职。
二月，左命军队种树。
七月，沙俄由平凉进驻静宁。左写信给刘锦棠，表示对沙俄入侵要“急为之备”。
八月，进驻安定。
同治十一年（1872年），六十岁
正月，河州回军首领马文禄投降。
二月，涂占彪率蜀军进至肃州（酒泉）城外。
六月，派刘锦棠、何作霖进军西宁。
七月，从安定入驻兰州。不久，刊发《学治要言》。
年底，设甘肃制造总局于兰州。
同治十二年（1873年），六十一岁
二月，马桂源兄弟投降，被处死。左上折总理衙门，指出：“欲杜俄人狡谋，必先定回部；欲收伊犁，必先克乌鲁木齐。”
七月，自兰州起程赴肃州“督师”。长子孝威卒于家。
八月十二日，至肃州。
九月十五日，马文禄投降，二十三日，杀毙降众数千人，任协办大学士。
十一月，在巡视嘉峪关后返回兰州省城。
十二月，上书说明各军出关准备。
同治十三年（1874年），六十二岁
正月，刊发《种棉十要》和《棉书》，张曜一军抵玉门。
七月，被晋升为东阁大学士，留督陕、甘。
八月，清廷命左为督办粮饷转运，袁保恒副之。
光绪元年（1875年），六十三岁
一月初三日，清廷密谕左宗棠，命其对塞防和海防问题“妥筹密奏”。
二月初七日，左上《复陈海防塞防及关外剿抚粮运情形折》，力主出兵收复新疆。二十八日，任钦差大臣，督办关外剿匪事宜。
六月二十八日（7月30日），上疏陈述出关用兵的筹划情形。
八月，奏以刘锦棠总理行营营务处，率老湘军从征起刘典帮办陕甘军务。
光绪二年（1876年），六十四岁
正月二十八日，老湘军自凉州（武威）进肃州。
二月，刘典至兰州，与商留后事。率军自兰州西进。
三月，借外商款300万两以充军费。十三日抵肃州。是月，湘军分别出关。
四月，刘锦棠督大军继发，左嘱以“缓进急战”。运储巴里坤存粮达600余万斤，运至古城400余万斤，运储安西、哈密达1000万斤。
五月，湘军前锋至巴里坤。
闰五月，进古城，时金顺驻济木萨（距古城90里），刘锦棠会见金顺，共商进兵之策。
六月二十一日，夜袭黄田。二十八日，攻克古牧地，歼敌6000人。翌日，收复乌鲁木齐。
九月，收复玛纳斯南城。
十月，左致书刘锦棠，决计于来年开春发动第二次攻势。
十一月，左建议将金顺部裁并为20营。
十二月，上奏折要求借洋款1000万两，以济军需。
光绪三年（1877年），六十五岁
二月，金运昌率“卓胜军”出关，左通令前线各军申明纪律，严禁杀掠，并宽待降者。
六月，左将蜀军调回巴里坤、古城，派易开浚率“安远军”接防吐鲁番。
七月十七日（8月25日），西征军开始进攻南八城。在此前后，左宗棠一再告诫所部将领，此次作战，是收复故土，西征军是“吊伐之师”，应以“王土王民为念”，必须申严纪律，公买公卖，做到秋毫无犯。
十二月，因收复新疆有功，左被晋升为二等侯爵。
是年，陕西与宁夏庆阳府大旱，左组织救灾。
光绪四年（1878年），六十六岁
正月再次奏请将新疆改设行省。
七月，奏参查禁种罂粟不力人员。
十月，上奏新疆善后方略，第三次请奏将新疆建为行省。
是年，奏准在兰州创设机器制呢局。
光绪五年（1879年），六十七岁
三月，左上奏清廷，就崇厚赴俄谈判之事，提出具体意见。
六月，在肃州开金矿。
七月，艾克木汗等再次犯境，进攻色勒库尔。
十一月，部分织呢机器抵兰州。
光绪六年（1880年），六十八岁
二月，左上疏拟分兵三路收复伊犁。
四月，第四次请将新疆建省，请派督、抚筹备。十八日，起程出关，以示抗俄收回伊犁的决心。
五月初八日（6月15日），抵哈密，设抗俄司令部于城西之凤凰台，饬各军戒备。调新至各营设防于巴里坤、古城、安西，在科布多和古城间增设台站。清廷命曾纪泽将崇厚免斩罪，知照俄国。
七月初六日（8月11日），清廷命左宗棠来京，以刘锦棠接替督办新疆军务。
八月十二日（9月16日），甘肃织呢总局开工生产。
十月十二日，从哈密入关。
十一月二十一日，行抵兰州。
十二月初四日，从兰州出发东向。是年用机器治泾河。
光绪七年（1881年），六十九岁
正月二十六日（2月24日），曾纪泽与沙俄订立《中俄伊犁条约》和《陆路通商章程》，伊犁地区西部被并入俄国。左宗棠行抵北京。在赴京途中，致书刘锦棠说：“现在俄军集结辉春等处，我国非将黑龙江以北、乌苏里江以东大片失地收回不可。”左到京后，清廷命他在军机大臣上行走，管理兵部事务，并在总理衙门上行走。左宗棠不满清朝政府，一再请求开缺回籍。
四月，调所部兴修直隶水利。
五月，亲至涿州视察水利工程。
六月，取道石景山还京。
九月，出任两江总督兼南洋通商大臣。
十月，出京南下。
十一月，抵长沙。
十二月初二（1882年1月21日），至湘阴故里。初八，起程赴两江总督任。二十二日，至江宁。
光绪八年（1882年），七十岁
正月，出江宁阅兵。
二月，巡视江北水利工程，二十五日还江宁。
四月，复奏淮盐引案。出阅江南防军，出吴淞口，至上海，法军占领越南河内。二十七日，还江宁。
七月，第五次奏请将新疆建省。
十一月，修筑范堤。为胡恩燮父子所办利国驿煤矿请求减税。
光绪九年（1883年），七十一岁
正月，自江宁沿江而下，巡视水利工程。
三月，疏请筹办海防，创办渔团。
六月，藩司王德榜由南京乘轮回湖南原籍时，左嘱王将其筹集的大量军械弹药转运广西。自请赴滇、粤督师。
七月，左上奏，建议由王德榜在籍招募楚、粤勇丁，组织成军，增援广西抗法前线。
九月，出省校阅沿海渔团，至崇明，集各军申明纪律。
十月，还江宁，目疾加剧。檄王德榜在籍（永州）招募楚、粤勇丁，组成十营，取名“恪靖定边军”，整装待发。
光绪十年（1884年），七十二岁
正月，目疾更重，扶病考察水利形势。
二月，还江宁，朱家山河工成。因病给假四个月。法军攻占北宁、太原。左宗棠不待假满复出。
四月，李鸿章与法国代表福禄诺在天津签订《中法简明条约》五条。当时左宗棠正在起程赴北仁途中，听到签约消息，立即写了一份《时务说帖》，进陈总理各国事务衙门，力斥和议之非，请准许他去广西前线指挥抗法军事。
五月二十日（6月13日），左宗棠至北京，入军机。
闰五月初一日（6月23日），法军撕毁条约，进攻北黎观音桥中国军队阵地，守军抗击，重创法军。清廷命直隶提督刘铭传督办台湾事务，并给巡抚衔。左宗棠奏荐曾纪泽担任两江总督。
七月十八日（9月7日），清廷命左宗棠为钦差大臣，督办福建军务。二十六日起程出京。
八月二十六日（10月14日），抵江宁。
十月二十七日（12月14日），率军数营抵福州，即整顿防务，设沿海渔团，并调兵援台，福州人心大定。
十二月，巡视长门、金牌炮台，严申军纪，封塞海口。上《试办台糖遗利以浚饷源折》，提出试办糖厂，以挽利权，主张将来招商入股，转成商办。
光绪十一年（1885年），七十三岁
三月十四日（4月28日），上奏要盟宜防，防兵难撤，痛斥投降派误国。
四月二十七日（6月9日），李鸿章与法国公使巴德诺在天津签订《中法会订越南条约》十款，承认法国占领越南。左奏请开铁矿，造大炮，以固海防。
六月，奏请移福建巡抚驻台湾。
七月二十七日（9月5日），病逝于福州。谥文襄，有《左文襄公全集》传世。
光绪十二年十一月十五日（1886年12月10日）
葬于湖南善化（今长沙）八都杨梅河柏竹塘。