牙菌斑不会自行脱落，漱口只能清除牙菌斑表面的白垢，那么如何控制牙菌斑呢？使用牙刷及牙线等工具是自我菌斑控制的最好方法。
（1）刷牙。刷牙是清除牙菌斑的基本措施，也是最重要的一种方法。如果刷牙得当就可以使牙齿表面的牙菌斑量大为减少，因此我们必须养成每天早晚刷牙的好习惯，并掌握正确的刷牙方法。
（2）牙线。刷牙最高的菌斑清除率是80％，一般情况下，由于人们早晚刷牙习惯、刷牙方式、刷牙时间等因素的影响，最终只能达到40％～60%的牙菌斑清除率，余下的主要存在于牙间隙，使用牙线可以将其清除。
（3）牙签。在牙龈萎缩，牙与牙之间出现间隙（牙缝）的情况下，就要借助牙签来清除牙齿邻接面的食物、软垢和部分牙菌斑。目前我国市场上出售的牙签的横断面是圆形的，国外也有横断面为三角形的牙签。
（4）牙间刷。牙间刷由刷毛和持柄两部分构成，在设计和规格方面有多种多样，可根据牙间隙的大小进行选用，能有效清除牙齿邻接面的牙菌斑。
（5）牙膏。刷牙时要使用牙膏用以摩擦牙面，加强刷牙时清除牙菌斑的作用，使牙齿清洁美观。牙膏中的芳香剂还有爽口、减轻口臭的作用。若在牙膏中加入一些药物称为药物牙膏，通过用药物牙膏刷牙可起到一些相应的作用，但若有牙病还是要先去看牙医，听听医生的建议，而不能单纯依靠某种牙膏来自行治疗牙病，以免耽误病情。
（6）漱口和漱口液。漱口是清洁口腔的一种方法，主要原理是利用液体在口内流动的冲击力来清除滞留的食物残渣，但漱口不能清除牙菌斑。在漱口水中加入一些药物成分，称为漱口液，漱口液可减少牙菌斑的形成，对减少龋病和牙周疾病的发生起一定作用，但也不能滥用。