近年来，消费者对果酒品质的追求在很大程度上促进了果酒生产新工艺、新技术的深入研究。研究发现，水果的成熟、乙醇的生成、苹果酸-乳酸发酵、风味物质的释放以及各种果汁的榨取、澄清和过滤都是酶作用的结果，酶影响着果酒酿制的各个重要环节。这些发现以及酶制剂工业的飞速发展使得酶制剂在果酒工业中得到越来越广泛的应用。在果酒生产中使用的酶制剂主要有果胶酶、纤维素酶、半纤维素酶、淀粉酶、蛋白酶和风味酶等。
酶在果酒酿制各个重要环节的作用主要体现在以下几个方面：
（1）酶可以提高出汁率和缩短压榨时间。制汁是果酒生产的关键作业之一，这一工序要求尽可能地提高出汁率和缩短压榨时间。已知出汁率的高低与原料的破碎程度有关，适当提高原料的破碎程度有利于提高出汁率。果实细胞其细胞壁的构成物质是纤维素、半纤维素和果胶等物质。细胞壁的结构较紧密，通常情况下单纯依靠机械或化学方法难以将其充分破碎，但通过添加一定量的果胶酶、纤维素酶和半纤维素酶使得细胞的这些构成物质水解，破坏细胞的网状结构，提高果实的破碎程度，从而就能在压榨时达到提高出汁效率并缩短压榨时间的目的。同时，把大分子的果胶物质降解后，也有助于提高后一阶段的澄清和过滤作业。
（2）应用酶有利于汁液的澄清。在果酒的生产中有两种澄清作业，一是果汁的澄清，二是原酒的澄清。果汁澄清的目的是在发酵前将果汁中的杂质尽量减少到最低限度，以避免果汁中的杂质参与发酵而产生不良成分，给果酒带来异味。原酒澄清的目的是为了避免果汁在贮存过程中酒石结晶沉淀或无定形的色素微粒自行沉淀出来以及出现蛋白质混浊、微生物混浊等不良现象，从而保证得到品质较高的果酒。两种澄清作用中，酶制剂主要用于果汁的澄清，所用到的酶主要有果胶酶、淀粉酶，此外还有蛋白酶。在使用酶制剂对果汁进行处理时要注意温度、pH值等的影响，如用果胶酶澄清葡萄汁，只能在常温、常压下进行，通常24小时左右可使果汁澄清。
（3）酶可以提高过滤能力。果酒的透明度是果酒质量的一项重要指标，要获得清亮透明的果酒，过滤则是一项必不可少的技术手段。过滤是用多孔隔膜进行固相物质与液相物质分离的操作，其作用效果受被过滤物料的物理性质如液体黏度、固体颗粒大小等因素影响。在进行果汁或原酒的过滤时，如果黏度过大或者其中的固体颗粒过大，则很容易堵塞过滤层，使过滤能力下降。导致汁液黏度较大的主要原因是残留的果胶物质、淀粉及一些中性低聚糖等作用的结果，因此如果在过滤前的操作中利用果胶酶、淀粉酶等将这些物质水解，降低汁液的黏度，就能提高过滤能力和加快过滤的速度。据报道，将酶制剂应用于超滤工艺中，能够较好地解决超滤膜堵塞和清洗的问题，从而提高超滤膜的通透量和缩短超滤膜的清洗时间，所用到的酶主要有淀粉酶、果胶酶、半乳聚糖酶、阿拉伯聚糖酶等。
（4）酶应用于浸渍芳香物质，改善果酒风味。果酒的风味也是衡量果酒品质的一项重要指标。果酒的风味物质主要来自水果本身和发酵过程，酶制剂在这方面的应用主要是针对前者。
（5）酶应用于提取色素物质，改善果酒的色泽。一些果酒须持有一定的色泽，如红葡萄酒，因此其色泽也是衡量其品质的一项重要指标。在这类果酒生产中必须提取出一定的色素物质。在果浆或果汁中加入一定量的果胶酶和蛋白酶，果胶酶能水解果胶物质破坏细胞结构，蛋白酶则能破坏液泡膜，从而释放出花青素等色素物质。
（6）酶可以提高产品质量和产品的稳定性。各种水果中或多或少地都含有一定量的蛋白质，如果不经过处理，这些蛋白质就会残留在果酒中，容易在贮存中引起果酒的混浊和沉淀。因此，必须在装瓶前对果酒中的残留蛋白质进行处理，以保证产品的质量和稳定性。处理果酒中的蛋白质常用皂土吸附法，这种方法虽然较有效，但是皂土吸附剂对于各种蛋白质并没有专一吸附性。利用外加蛋白酶水解果酒中的蛋白质，也能取得较好的效果，并且不同的蛋白酶对不同的蛋白质具有专一性。此外，多数水果中含有的多酚氧化酶也容易使果汁或果酒发生氧化，不同程度地破坏果酒的色泽、风味，使产品质量下降，因此也有必要采取一定的措施以破坏多酚氧化酶的活性。