除了利用和稻谷清理一样的筛选法、风选法、密度法、磁选法以外，为了达到更理想的除杂效果，小麦清理还采用以下方法：
1.精选法有时候小麦中掺杂的杂质的宽度、厚度以及比重和小麦接近，如大麦、荞子和燕麦等不同种类的粮粒或杂草种子。这些杂质如磨入面粉中会影响粉色，含量较多还将影响面粉的烘焙性质。根据杂质与小麦籽粒长度和形状的不同进行清理的方法称为精选法。用来精选的设备被称为精选机。精选机又分为三种，即螺旋精选机、滚筒精选机以及碟片精选机。
2.打麦打麦是利用小麦与杂质强度的差别，采用对物料有打击作用的机械，将强度低的杂质打碎，从而把这些杂质分离出来的方法。
通过筛选、去石、精选、磁选，小麦中的大部分杂质虽然被清理，但是麦粒的表面还没有足够的干净。因此在小麦入磨之前必须将黏附在麦粒表面上的灰尘、麦毛、微生物、虫卵、嵌在腹沟中的泥沙以及残留的强度低于麦粒的并肩泥块和煤渣、虫蚀粒、病害变质的麦粒等杂质清除，提高面粉质量。
根据打击力的大小，打麦有轻打和重打之分，轻打的如擦麦机，重打的如打麦机。在小麦表面清理工艺中，擦麦机是一种打击作用较弱而摩擦作用较强的打麦设备，主要用于水分调节之前的轻打。
如果小麦制粉厂内没有洗麦机，则会使用打麦机对小麦的表面进行处理。
3.洗麦主要是为了洗去麦粒表面的污物，分离并肩石和病害麦粒。通过洗麦可以达到以下目的：可配合水分调节，对小麦起着水作用，以改善小麦制粉的工艺性能；洗掉麦粒表面的微生物、灰尘；洗掉麦粒表面上残留的熏蒸药剂，以降低小麦含药量；甩干后，可擦掉部分果皮，有利于提高小麦的清理效果；带有去石装置的洗麦，还可以分离并肩石、并肩泥和有害粮粒等。
洗麦对于小麦的清理是一项非常重要的工序，它可以提高净麦纯度，从而保证了面粉的质量。但因洗麦需要大量净水，使用后的污水多，且需净化的成本升高，因此，应据含杂的具体情况来决定是否使用洗麦机。
（三）小麦的水分调节和搭配
小麦入磨前需要进行水分调节和搭配，这是小麦清理工作中不能缺少的两大重要环节。
1.小麦的水分调节小麦水分调节是小麦在制粉前利用水、热、时间三种因素的作用，使其改善工艺性能，得到良好的制粉条件，保证面粉质量的重要工序。
（1）水分调节的作用
①保持入磨小麦中的水分适合，能够满足制粉工艺的要求，使制粉过程保持相对稳定，方便操作管理。这对提高生产效率、出粉率和面粉质量都十分重要。
②使皮层与胚乳间的结合力有所减弱，便于皮层和胚乳分离，有利于研磨、提高出粉率。
③增加小麦皮层韧性。在研磨小麦的过程中，可保证麸皮的完整性，减少面粉中混入的细麸屑数量，使粉色改变、灰分降低、质量提高。
④使小麦的胚乳结构松散，强度降低，易于磨细成粉，从而降低动力消耗。
⑤使面粉中含有的水分满足国家标准。
（2）水分调节的方法小麦水分调节的方法有两种：一种是室温水分调节（俗称发潮），另一种是加温水分调节。室温水分调节是在室温的条件下，小麦经过着水或者洗麦，存放进润麦仓中一段时间的一种水分调节方法。加温水分调节是将小麦着水或洗麦后，用水分调节器进行加热处理，再在润麦仓内存放一定时间的水分调节方法。目前，在国内受到广泛使用的小麦水分调节的方法就是室温水分调节法。
室温水分调节的过程，一般经过着水和润麦两个步骤。小麦经过着水设备着水后，通过螺旋输送机搅拌混合，使水分在麦粒间的分配较为均匀，然后送去润麦仓中放置一段时间进行润麦，将水分渗透进小麦的内部。小麦着水后润麦的时间一般是18~24小时。用于水分调节的设备包括强力着水机、水杯着水机和着水混合机。
2.小麦的搭配
（1）搭配的目的制粉厂使用的原料产地不同，具备的工艺性质也不同，如粉质、水分、面筋质、小麦色泽、皮层厚度和胚乳含量等方面均有差异，对生产过程、面粉质量和各项技术经济指标的稳定性，必然带来较大影响。小麦的搭配是指将各种小麦按一定的比例混合后的加工。其目的在于：
①合理利用小麦。在保证面粉质量的前提下，得到混合小麦的最高出粉率。
②保证成品的质量。如将红麦和白麦搭配加工，可保证面粉的色泽；将面筋含量高低不同的小麦或灰分含量不同的小麦搭配加工，可得到符合标准的面筋含量或灰分含量的面粉。
③使生产稳定。保证原料工艺性质相同，可以稳定生产过程以及生产操作，避免因为原料的变化所带来的设备负荷不均造成的故障。
④避免优质小麦单独加工的浪费，克服劣质麦（如发热、发芽、病虫害小麦）单独加工的弱点。保证了面粉的质量，也提高了出粉率。
（2）搭配的方法按国家规定的面粉质量进行小麦搭配，使之磨出符合质量标准的面粉，这是小麦搭配的主要原则。
①主麦仓搭配。制粉厂把不同性质的小麦分开储存，在使用时，打开几个麦仓，通过仓下的配麦器或者放麦闸门控制搭配比例，使小麦流入麦仓下的螺旋输送机或其他输送机中混合。
②润麦仓搭配。把各批次小麦分别
进行清理和着水以后送入不同的润麦仓，通过仓下放麦闸门或者配麦机调控好配麦比例，在螺旋输送机中混合。采用这种方法，可以根据小麦含水量的不同，分别掌握着水量和润麦时间，这是一种比较好的搭配方法。
（四）小麦清理流程
小麦的清理流程又叫麦路，麦路主要包括初清、毛麦处理、水分调节和净麦处理四个阶段。它是将各清理工序组合起来，按入磨净麦质量的要求，对小麦进行连续处理的生产工艺过程。麦路除了要完成对小麦的清理之外，还要完成对小麦的水分调节和搭配工作。
制粉过程中，麦路可以保证成品的质量，提高产品的纯度。完整的麦路可以提高产量、降低动力消耗以及提高出粉率。
小麦清理有湿法和干法两种。它们的区别在于麦路中是否使用洗麦机，采用洗麦机清理的麦路是一种湿法清理；没有的是干法清理。湿法清理耗费大量水，并且污水不容易处理，显露出被干法清理取代的趋势。
由于各地区小麦品质和含杂情况的不同，以及生产规模的不同，因而各制粉厂的麦路繁简不一。但其共同点在于：对杂质的清理，应本着先易后难的原则；在保证净麦质量的前提下，使麦路灵活，以适应原料工艺性质的变化；对杂质中的清理工序必须齐全，安排的工艺顺序要合理；各种清理设备都应有良好的密闭、吸风除尘措施，以保持单间和周围环境的清洁卫生；对危害大的杂质要特别加强清理。需要注意的是，虽然麦路有繁有简，但是清理后的小麦都应该遵循各项质量指标的规定标准。
清理流程举例：
初清后小麦寅筛选（带风选）寅磁选寅去石寅精选寅打麦（轻打）寅筛选（带风选）寅着水寅润麦寅磁选寅打麦（重打）寅筛选（带风选）寅磁选寅净麦仓
清理后的小麦要求杂质少于0.3%，其中沙石的含量少于0.02%，粮谷类杂质少于0.5%，不可含有金属杂质；灰分降低量超过0.06%，同时入磨净麦的水分适宜。
二、制粉工艺
小麦经过清理和水分调节，成为适合制粉的净麦。小麦制粉的目的是将小麦中的胚乳与皮层和胚分离，并且把胚乳磨成细面粉。
目前，世界上一般使用的面粉制作方法是把麦粒破碎，然后逐步研磨，将麸片上的胚乳刮下，同时将胚乳研细成粉。
制粉的设备包括研磨、清粉、筛理等设备。研磨设备的作用是将麦粒破碎，从麸皮上剥刮胚乳，最后把胚乳磨成面粉。磨面粉时常用到的设备是辊式磨粉机和协助磨粉的松粉机；清粉设备的作用是将粒度大小相同的麦心、麦渣和小麸片在气流的辅助作用下按质量进行分级，清粉常用的设备为清粉机；筛理设备的作用将研磨后的物料按粒度大小进行分级，同时筛出面粉，一般使用的筛理设备包括高方平筛、圆筛和协助筛理的打麸机和刷麸机。
小麦制粉工艺主要是研磨、筛理分级等。
（一）研磨
研磨是面粉制作过程中最重要的一环，制粉效果受到研磨效果的影响。
1.研磨的基本方法和原理小麦的研磨是利用研磨机械，将麦粒剥开，从皮层上剥刮下胚乳，并把这些胚乳磨成细粉，同时还应该维护皮层的完整性，以此得到高质量的面粉。研磨时的基本方法包括四种，即挤压、剪切、剥刮和撞击。
研磨就是通过对小麦的挤压、剪切、剥刮和撞击作用，使小麦逐步破碎，从皮层将胚乳逐步分离并且磨成有一定细度的面粉，研磨时主要会使用辊式磨粉机和撞击磨粉机。其中辊式磨粉机已被大多数面粉厂采用。
2.研磨系统在分级制粉过程中，按照生产先后顺序中物料种类的不同和处理方法的不同，把制粉系统分为四部分，即皮磨系统（B）、渣磨系统（S）、心磨系统（M）以及清粉系统（P），这四部分分别处理不同的物料，完成各自的功能。
（1）皮磨系统制粉过程中的最前面的几道是皮磨系统，它的作用是将麦粒剥开分离出麦渣、麦心和粗粉，保持麸片不过分破碎，以便使胚乳和麦皮最大限度地分离，并提出少量的小麦粉。在磨制标准面粉的时候，皮磨系统不仅要多出面粉，还要将一定量的麦渣和麦心提取出来；在磨制等级粉时，则要出大量的麦渣、麦心。
皮磨系统的工作好坏直接关系到麸皮刮净的程度、粗粒和面粉的质量以及渣磨、心磨系统的工作状态。因此，皮磨系统属于粉路中的基础系统，位于最重要的位置。在大型粉厂中，一般会用五道皮磨，1~2皮为前路皮磨，3~4皮为中路皮磨，5皮为后路皮磨。
（2）渣磨系统渣磨系统处于皮磨系统和心磨系统之间，如果制粉流程短，可不设该项工序。渣磨主要处理皮磨或其他系统分离出的带有麦皮的胚乳颗粒———麦渣。通过渣磨系统，使麦渣通过轻碾的方法，将麦渣上的表皮从胚乳颗粒上剥离，从中提出品质较好的麦心和粗粉，送入心磨系统中磨成优质的面粉，并且把提取出的麦麸屑送进相对应的系统中处理。
根据生产不同等级的面粉的要求，渣磨系统的任务也不相同。
在加工标准粉时，其任务以出粉为主，提麦心为辅；在加工特别粉时，则偏重于提取麦心，并将其送往心磨系统。
（3）清粉系统清粉系统结合风筛，分开皮磨和其他系统中提取的麦渣、麦心、粗粉连麸粉粒以及麸屑混合物，送到各自对应的研磨系统中进行处理。
（4）心磨系统心磨系统的任务是将皮磨、渣磨和清粉系统取得的麦心和粗粉研磨成具有一定细度的面粉，通过筛理，提出面粉，并分离出一定量的细麸皮。
各个系统碾磨以后筛出来的面粉一般是前路的质量好，后路的质量差；前路的数量多，后路的数量少。
（二）筛理
在制粉过程中，小麦经磨粉机逐道研磨后，获得颗粒大小及质量不一的混合物料。将这些混合物利用筛理设备将其按粒度大小分级的工序称为筛理。经过筛理而分离的大小物料，分别送进下一道磨剥刮和研轧。各道筛理设备如果不能把磨下物及时地提取处理，将会增大后续设备负荷，使产量降低，动耗增加，研磨效率下降；若对磨下物不进行分级就可能使后续各系统流量分配不平衡。
在研磨精度低、粒质粗糙的小麦粉的时候，可以采用比较少的研磨道数，也不需要高度分级；对小麦粉的质量要求越高，粉的粒度越细，则研磨道数越多，分级也越细。
筛理设备通常有平筛和圆筛两种。平筛是面粉厂的主要筛理设备。其作用是将各研磨系统的磨下物通过筛理，筛选出面粉并且把各个制品按照粒度分级，再分别送到相对应的系统中进行下一步处理。圆筛是另一种筛理机械。它主要是有一个沿水平轴旋转的圆筒形筛面，物料靠筛筒内的打板击向筛面而得到筛理。圆筛的筛理作用比平筛的筛理作用强烈，适宜于筛理水分比较大或者潮湿的吸风粉、黏性比较大的成团物料或者刷麸粉，筛面不容易堵塞。缺点是筛理面积小（在相同占地面积下），筛面利用率低，产量小，分级种类少，一般制粉厂均将其作为辅助筛理设备，在中小型厂中，也可作主要筛理设备。
专门用于处理麸片的设备包括刷麸机以及打麸机。这两种机器主要利用旋转的刷帚或打板，把黏附在麸皮上的粉粒分离下来，并使其穿过筛孔成为筛出物料，而麸皮则成为筛内物料。刷麸和打麸工序设在皮磨系统尾部，是处理麸皮的最后一道工序。
小麦经过研磨可以制成不同质量和大小的颗粒，这种研磨物料统一被称为在制品。利用筛理机械的筛理，可将在制品分为：
①粗粉：未磨细成粉的粉粒（加工特制粉时的在制品）。
②麦渣：带有麦皮的较大胚乳颗粒。
③粗（细）麦心：混
有麦皮的较小（更小）的胚乳颗粒。
④麸片：呈片状带有不同程度胚乳的表皮。根据上述的物料，小麦制粉过程所用的磨，便可分为皮磨、心磨和渣磨；筛便有不同粗细度筛网的筛。
（三）清粉
1.清粉的目的平筛对于筛理物是按照粒度进行分级的，分离出来的相同粒度的物料里面，包含着三种质地不同的物料，即连麸胚乳粒、纯净胚乳粒和细麸皮粒。通过筛理很难把这三种物料分开。