作为制药原料，应尽可能地保证脏器的新鲜、卫生，减少脏器组织结构变化和物理、化学方面的变化，最大程度地制止组织的生物化学过程，杜绝自溶、腐败的现象发生。因此，在动物屠杀以后，必须尽快取出脏器进行加工利用。如条件不具备，应采取有效方法加以保存，再送往有关单位。
常用的脏器贮藏方法有下列几种：
（1）冷冻升华干燥法。它是一种最好的保存脏器原料的方法。即在-40℃～-30℃时，使脏器组织中已结成冰的水分，在0.001～0.005毫米真空状态下直接升华而干燥。这种方法可使脏器中的有效成分不致破坏，但成本较高，只能用于保存价值较高的腺体。
（2）冰冻法。将脏器组织平铺于瓷盘或其他盘中，高度不超过10厘米，立即送入冷冻库中，在-20℃时进行速冻，然后在冷库中贮藏。在这样的温度下可保藏较长时间而不会导致原料变质。
（3）有机溶剂脱水法。一般采用丙酮浸泡脱水。由于连续几次经丙酮处理后，可使原料中水分降到10％ 以下，且对原料有效成分无影响，也可保存较长时间。但丙酮价格比较贵，只适用于价值较高的腺体。（4）化学防腐法。通常用盐或硫酸铵腌制后阴干保存。此法对原料的一部分有效成分有所破坏，但由于简单易行，故那些价值低廉的工业原料，如胰腺等可以采用本法。
（5）真空灭菌干燥法。本法是将附着于脏器上的脂肪、结缔组织彻底除去，经搅碎后（如脂肪过多，可用有机溶剂甲苯、丙酮等进行一次脱脂），在不超过70℃的温度下用真空干燥器进行干燥，最后磨成粉末保存。如无真空干燥设备，亦可利用蒸汽或明火加热，在严格控制温度的条件下进行干燥，但有效成分损失较大。