在空气中，氧气和二氧化碳是影响草菇生长发育的重要因素。一般在正常的空气中，氧气的含量约为21％，二氧化碳含量约为0BF．BFQ03％。草菇菌丝在呼吸时吸收氧气而排出二氧化碳，当空气中二氧化碳浓度过高时，必然会影响草菇的呼吸活动和生长发育。
草菇是好气性真菌，特别是在30℃的环境条件下生长，其呼吸代谢非常旺盛，需要消耗大量的氧气。因此，生长发育过程要求较充足的氧气，如果空气不流通，氧气不足，就会抑制草菇菌丝的生长和子实体的发育。
草菇在子实体分化阶段，对氧气的要求量稍低，此时空气中的二氧化碳浓度适当高些反而对子实体的分化有利。一旦子实体形成后，其呼吸代谢旺盛，对氧气的要求也就急剧增加。这时，空气中二氧化碳浓度达到0BF．BFQ1％时，对子实体就有毒害作用，导致子实体发育畸形，甚至完全抑制子实体的形成，并导致菇体死亡。但如果通风量过大，水分容易散失，而影响子实体的分化，同时对子实体的生长也不利。