白灵菇是好氧性菌类，子实体生长发育过程中新陈代谢旺盛，要消耗大量的氧气，排出二氧化碳，如果菇房通风不良，二氧化碳浓度过高后，菇柄会长长，菌盖生长会受控制，长成畸形菇。如果在高温期间，易造成高温高湿的环境，引起子实体腐烂发臭。
为了使白灵菇子实体成型期成为菌盖大、菌肉厚、菌柄细小的扇形菇，除注意温度管理外（不低于80℃），通风也是一个重要的因素，但通风要和保温、保湿相结合。
生产中常出现通风影响温度和湿度的现象。因此，在低温季节，通风要在中午进行，有时在喷水后进行。日光温室和塑料大棚密封性好，要特别注意通风，建造时要留好通风窗和可以使空气对流缓慢的门窗。总之，通风时要和调温、控湿相结合，使通风、温度、湿度三者相协调，不能顾此失彼。