接种室又称无菌室（如图3所示），是分离菌种和接种菌种用的小房间，分里外两间，高2米左右，外间为缓冲间，约2～3平方米，用于放工作服、口罩、帽、拖鞋、小喷雾器和消毒剂。里间为接种间，面积约5～6平方米，有工作台或桌子、凳子、接种用的各种工具。
图3接种室结构示意图
房间不宜太大，墙、地面要光滑、平整，便于擦洗消毒。门窗要严紧，门是推拉式，里外间的两个推拉门位置相错而不要相对，间距尽量远些，里间的推拉门要离工作台远些，这样人进入接种室时，外面的空气不易直冲到里面。在里间的推拉门上，开个推拉式的小窗，工作时，临时传递一些急用的小东西，以减少人员的进出，有利于降低污染。
里外间都要安装照明灯和紫外灯，30瓦的紫外灯的杀菌范围为2米，1．2米内最好，紫外灯的安装位置要合理。接种室在接种前，采用紫外线照射和喷洒低毒杀菌剂进行消毒灭菌。
一般消毒灭菌不易彻底，工作人员进入时，又带进外面的空气，所以工作中间，人员不要进出，并严格按照无菌操作程序进行。