人工栽培的金针菇类型，按出菇的快慢、迟早分为早生型和晚生型；按发生的温度可分为低温型和偏高温型；按子实体发生的多少，可以分为细密型（多柄）和粗稀型（少柄），菇农可根据自己的情况选择合适的菌种。
（1）三明1号菌株：栽培普遍，该菌菌丝生长快，7天可满管，25～30天菌丝可长满瓶或袋。出菇快，30多天即可出菇；栽培周期短，70～80天便可完成整个栽培周期。产量高，生物效率可达70％～100％。质量好，菌柄粗细均匀，色泽淡，人体所需的8种氨基酸含量占氨基酸总量的44．5％，高于一般菇类。适温宽，3℃～21℃下均可出菇。抗逆性强，病菇与畸形菇少。
（2）浓色品系007、008：幼菇菌盖淡黄至黄褐色，菌柄上部色淡，为白色至浅黄色，下部色深，为金黄至暗褐色，密被褐色短绒毛。抗逆性强，接种后菌丝吃料快，出菇早，产量较高。菇蕾生长期间只需微弱散射光（5～10勒克斯），菇体颜色随光照增强而加深。浓色品系金针菇菌盖软滑，菌柄脆嫩，香味浓郁，适于生产鲜菇内销。
（3）白色品系F21：浙江省江山市微生物研究所菌株。出菇整齐，每丛200株左右，柄长15～23厘米，菌盖内卷，不易开伞。白色品系对光线不敏感，即使栽培环境有较强的散射光，子实体仍是通体洁白，有光泽，适合制罐或盐渍加工出口。
白色品系金针菇菌丝生长较慢，抗逆性差，抗杂能力弱。瓶、袋栽培时，菌丝不易长透培养料。出菇期间对二氧化碳耐受力弱。在通气不良的环境中，菇蕾发生虽多，但成菇数量少，且菇柄易扭曲、畸形或腐心。这种现象在后期尤其严重，故生产中常只收前两茬菇，所以产量较低。白色品系金针菇菇体洁白，适合于加工成出口商品。因其味淡，内销有时不及浓色品系金针菇受欢迎。
（4）杂19：福建三明真菌研究所选育，菇体白至浅黄色，下部黄至浅褐色，菌丝生长温度3℃～30℃，最适温度22℃～24℃，子实体形成温度3℃～18℃，最适温度13℃～15℃，生物学效率80％～120％。
（5）苏金6号：江苏省微生物研究所选育。菇体白色至浅黄色至黄色，菌丝最适生长温度22℃～24℃，子实体形成温度3℃～20℃，最适温度13℃～15℃，生物学效率80％～120％。
（6）FU088：河北省微生物研究所引进选育，菇体纯白色，不易开伞，菌丝生长温度3℃～30℃，最适温度22℃～24℃，子实体形成温度3℃～18℃，最适温度12℃左右，生物学效率60％～80％。