施用沼肥的水稻植株清秀健壮，病虫害轻，后期不早衰、不贪青，成熟时转色落黄一致；成穗率高，有效穗多，穗粒数多，结实率高，谷粒饱满。其操作方法和技术要领如下：在翻耕稻田时，应将沼渣与泥土混合，作为基肥。每亩施用沼渣约2 000千克。
一季晚稻采取“稳前、攻中、补后”的施肥方法。双季稻采用“重前、控中、补后”的施肥方法。在返青分蘖期，每亩施用沼液1 000千克，并同时撒施尿素5～10千克。在拔节长穗期，如果长势较差，每亩用沼液50千克兑水50千克，再加入尿素1～1.5千克喷施。在灌浆结实期，每亩用沼液50千克兑水50千克，再加入3％的磷酸二氢钾喷施。
值得注意的是，施用沼液时，应适量掺水，以避免伤害水稻的幼根或嫩叶。施用沼渣时，也不要直接接触水稻的根。