（1）提高温度，节约能源。大棚蔬菜生产的关键因素是温度。靠常规能源取暖增温消耗过大，增加了成本，且不太方便，而沼气制取简单，无需专人看管，且投资少，受益期长。另外，沼气的热值较高，一般为2.09×104～2.3×104千焦每立方米，按5立方米容积的沼气池算，日产气量4～5立方米，按6～7分地的大棚计算，早上温度最低时点燃，每天可为大棚提供11万千焦的热量，可使棚内温度上升2℃～3℃，防止冻害，并为生活带来方便。
（2）提供肥料。沼渣、沼液是腐熟无菌、速迟兼备的优质肥料。作物秸秆、牲畜粪便及人类粪便、环境垃圾等经过入池发酵，产生大量沼气，沼气池中的厌氧环境会导致粪便中的大量病原菌降低活性或死亡，从而形成优质无菌的有机肥料——沼渣，此种有机肥的有机质及氮、磷、钾含量明显高于沤制的土杂肥。经过发酵，粪肥的有效氮提高可40%，肥效可提高20%，长期使用可以改良土壤结构，增强土壤保肥、保水能力。沼气发酵的另一种副产物——沼液，是一种溶肥性质的液体，其中不仅含有较丰富的可溶性无机盐类，同时还含有多种沼气发酵的生化产物，其含有的水溶性的多种营养成分是一种速效肥料，具有易被作物直接吸收及营养、抑制、刺激、抗逆变等效果。使用沼液喷洒植株，可起到杀虫、抑菌的作用，减少农药使用量，达到农药低残留，生产出无公害蔬菜，提高菜价，增加收入。
（3）提供气肥。沼气通过燃烧放出二氧化碳，使棚内二氧化碳浓度增高，解决棚内气肥不足问题。这些气体能促进植物的新陈代谢，有利于植物的生长和碳水化合物的积累。如果温度适宜，这些积累的化合物可转化为糖，增强蔬菜的品质和适口性。
据试验，棚内施气肥，黄瓜结果率提高10%，辣椒产量增加12%，西红柿增产15%左右，其他蔬菜也有较明显的增产效果。但是棚内使用气肥二氧化碳的浓度不宜过高，最好控制在1‰～1.5‰之间，过量使用不但不会增产，反而会导致植物气孔关闭，出现不良现象。