查出沼气池漏水、漏气的确切部位后，做上记号，根据具体情况加以修补。
（1）先将裂缝的部位凿成“V”形。周围打成毛面，再用1∶1的水泥砂浆填塞漏处，压实、抹光，然后用纯水泥浆粉刷几遍。
（2）将气箱粉刷层剥落，翘壳部位铲掉，重新仔细粉刷。
（3）如果漏气部位不明确，应将气箱洗刷干净，用纯水泥浆或1∶1的水泥砂浆交替粉刷3～4遍。
（4）导气管与池盖衔接处漏气，可重新用水泥砂浆填塞漏处，并加高和加大水泥砂浆护座。
（5）池底全部下沉或池底与池墙四周交接处有裂缝的，先把裂缝剔开一条宽2厘米、深3厘米的围边槽，并在池底和围边槽内，浇注一层约4～5厘米厚的细石混凝土，使之连接成一个整体。
（6）由于膨胀土湿胀、干缩引起裂缝的沼气池，应在池盖和进料管、出料间上沿的四周铺上三合土，以保持膨胀土干湿度的稳定。