（1）沼气池在密封的情况下，加水试压和进料的速度不能过快，特别是当液面淹过进料管口、出料间的挡板后，更要放慢速度，以免池内气体压力急剧增大或减小而损坏池体。沼气池出料时，也不要过快、过猛，以免产生较大负压而破坏池体。在大量进料、出料时，要把输气导管拔掉，有活动盖的要打开活动盖（此时严禁有烟火接近沼气池），防止产生过大的正压或负压。用抽水机抽出料液或加水时，更应特别注意这一点。
（2）新建沼气池一旦投料后，就会发酵产气，如果需要继续加料，只能从进料口或活动盖口处加入，严禁人进入池内加料、搅拌和打捞杂物，以免发生窒息、中毒事故。
（3）严禁在进料和出料时使用沼气，以避免引起回火，造成爆炸或火灾等事故。
（4）向沼气池中投完料后，在放气试火时，严禁在沼气池顶部的导气管口直接点火，以避免引起沼气池回火爆炸，发生火灾，造成人员伤亡。
（5）误投易堵塞进、出料口的物品或原料，造成沼气池被堵塞时，严禁人直接进到沼气池内清除堵塞物，可以在进、出料口处用长把钩子清除，或者将活动盖打开半天充分通气后，在池顶外面用长把钩子清除堵塞物。
（6）沼气池的进料口、出料间加装防护盖。农村户用沼气池一般均建造在地下，并且深度一般都在2米左右。沼气池，尤其是发酵间又处于严格的密封状态，一旦人、畜掉入池内，容易造成人、畜伤亡等事故。因此，为了使用和管理都安全，沼气池的进、出料间口一定要用结实的材料（如石板、厚木板等）盖上。