中小学心理健康教育在经过十几年的实践之后，开始有了比较大的发展，主要表现在以下几个方面：第一，建立了中小学心理健康教育的组织机构，并得到相应的行政部门的支持。一些省市相继成立了地区性的学术组织，如上海市中小学心理辅导协会、湖南省中小学心理教育专业委员会、河北省人格发展与心理健康教育研究会。
第二，出版了一系列学校心理健康教育的读物，同时还研制了一些测量心理健康的量表、软件。中科院心理所、华东师大、华南师大等编制了大量心理量表和计算机辅助测量软件等技术性工具。出版社也陆续出版了一系列有影响的专著、读物与教材，如班华主编的《心育论》、刘华山主编的《学校心理辅导》、吴增强主编的《现代学校心理辅导》、郑和钧的《学校心育系统协同构建的理论与实践》、陈家麟的《学校心理健康教育——原理与操作》、叶一舵的《现代学校心理健康教育研究》、郑日昌主编的《学生心理健康文库》、黄希庭主编的《中学生心理健康》、江海燕主编的《中小学心理健康教育丛书》、高学贵主编的《学校心理的十万个为什么》、郑日昌主编的《中小学心理健康教育》（共22册）、沃建中主编的《小学生心理导向》和《中学生心理导向》、王希永等主编的《心理发展》、广州市学校心理教育研究会编的《心理健康教育》、郭斯萍等主编的《心理健康教育》、叶一舵主编的《小学生心理健康教育实验读本》（共12册）等。
第三，进行了系统的课程试验。课程试验的内容和形式包括开设心理健康课程、开展心理健康教育的专门活动等。
第四，国家和地方均出台了一系列相关的文件。
1994年《中共中央关于进一步加强和改进学校德育工作的意见》中提出：要通过各种形式对不同层次的学生进行心理健康教育和心理指导，帮助学生提高心理素质，健全人格，增强承受挫折、适应环境的能力。《中共中央国务院关于深化教育改革全面推进素质教育的决定》中也明确指出，要“加强学生的心理健康教育，培养学生坚忍不拔的意志、艰苦奋斗的精神，增强青少年适应社会生活的能力。”1999年，教育部下发《关于加强中小学心理健康教育的若干意见》，对充分认识中小学心理健康教育的重要性、开展心理健康教育的基本原则、心理健康教育的主要任务和实施途径、心理健康教育的师资队伍和条件保障、心理健康教育的组织领导、当前开展心理健康教育需要注意的几个问题等方面提出了明确的要求。2002年，教育部又下发《中小学心理健康教育指导纲要》，对中小学心理健康教育的实施提出了更具体的要求。与此同时，一些省市区也陆续出台了有关文件，对贯彻中共中央、国务院、教育部的文件提出了相应的要求。上述文件为中小学开展心理健康教育提供了强有力的政策支持，标志着学校心理健康教育不只是学校的行为，而是国家规定的素质教育行为，是全面实施素质教育的客观要求。
第五，涌现了一批心理健康教育特色学校。如上海的曲阳四小、徐汇区二小、南洋中学、风华中学，江苏的金陵中学等。
三、当前我国学校心理健康教育存在的问题
（一）发展迅速，但地区差别大
十几年来，我国中小学心理健康教育从研究到实践已经逐步开展起来，并取得了明显的成效。但是，我们也应看到，当前我国中小学心理健康教育处于初级发展阶段，存在的问题也十分明显。从全国范围看，中小学心理健康教育发展很不平衡，城市快于农村，沿海快于内地，有些地区的研究和实践取得了很好的成绩，而有些地方刚刚起步，有的甚至几近空白。即使是在一个地区，也由于缺乏统一规划、指导，各校之间的发展也很不平衡。理论研究不尽如人意，学校心理健康教育理论体系尚未定型。
目前我国对学校心理健康教育的理论研究大大滞后于中小学心理健康教育的实践。对于诸如学生心理健康的标准，心理健康教育及其相关概念的定义，学校心理健康教育的目标、内容、方法、评估手段以及学校心理健康教育与德育的关系等问题，学术界至今尚无统一的看法。学校的教育实践得不到应有的理论指导，一些学校的领导和老师既未看清心理健康教育和思想政治工作的内在必然联系，也没有弄清二者的区别，实践中常把二者割裂或等同起来。
（二）科学化、专业化水平不高
譬如，作为心理健康教育的一个重要手段，心理测量常常是不可或缺的。但心理测量是一项专业性技术性很强的工作，对使用者的资格有一定的要求。从对测量者、测量环境、测量时间、被试心境等因素的控制到测验工具的选用、使用以及对测验结果的解释，都必须采取规范、科学、慎重的态度。为了保证心理测量的客观、正确，量表和问卷常模必须是科学的，必须考虑其适用范围。然而，目前科学的评估技术应用不足，出现的某些量表缺乏科学依据，测试结果又大相径庭，测试缺乏信度与效度，仅凭这样的测试结果来断定学生心理显然存在诸多问题。此外，有的学校由未曾受过任何相关培训的学科教师兼任心理健康教育工作。还有，有的学校的心理辅导活动停留于一般的谈话，缺乏一定的咨询技巧。
（三）形式多样，但缺乏规范
当前开展心理健康教育的途径很多，形式多样，但有的学校东打一拳，西打一拳，看似热热闹闹，实则空忙一场。这是没有从整体上规划学校心理健康教育，使之形成有效的运行系统，融入整个学校教育系统中去进行运转的结果。心理健康教育不是学校教育的附属物，也不是临时性任务，而是一项有明确目标和内容的专门教育活动，是学校素质教育的组成部分，应该有专人管理，具有专业教师、专门课程，在专家指导下进行，注重其专业化和规范化。
（四）专业人员匮乏
这是开展学校心理健康教育过程中一个较大的问题。20世纪90年代以来，北师大、中科院心理所成功地举办了多次心理教育教师培训班，但由于数量有限，仍很难满足实际需要。目前，有些高校已设立该专业，培养这方面的人才，但高校的培养模式及其规模显然无法即时满足中小学心理健康教育的需要。因此，当前的当务之急是举办不同层次的培训班，对一批具有心理健康教育意向或有一定教学经验的在职教师进行多种形式的培训，以为学校心理健康教育工作培养急需的骨干人才。
四、我国学校心理健康教育的发展趋势
21世纪我国学校心理健康教育将出现以下发展趋势：（一）学校心理健康教育普遍化
随着心理健康与身体健康同样重要的观念的深入人心，人们将普遍意识到心理健康对个人发展乃至社会发展的重要作用。青年一代是民族的未来，学校要为社会发展培养优秀的人才，就必须重视心理健康教育。从学校的层面上说，未来心理健康教育将渗透在教育观、人才观中，成为学校发展的内在要求。在承认学生差异的基础上尊重每一个学生的个体存在，帮助每个学生发展自我的潜能，实现自己的价值。从学生的角度上说，从沉重的学习负担中解放的学生会更加注重自身全面的发展，意识到全面发展的人才能适应未来的社会，取得成功。心理健康教育必将由现在的少数实验学校逐步扩展到一般学校，由经济发达的地区逐步扩展到经济欠发达地区，直至建立相应制度，步入正规化，成为全社会、全民族的共识。
（二）学校心理健康教育规范化
未来学校心理健康教育将形成科学的、系统的、规范的工作模式，实现可复制、可操作。学校心理健康教育工作规范化的最重要标志是学校心理健康教育工作者专业化水平的提高。美国教育家托马斯曾说：“一所好学校就是那种在其教与学中能成功体现对人、真理、正义和责任感尊重的地方。教育的这些首要的道德既是其自身目标，也是实现的手段，而忽略这些精神和文化品德的学校，无法使它的学生发展成精神、道德、社会、文化、审美、心理和体育等方面都健康的全人”。教师是直接体现学校职能的环节，作为“人类灵魂的工程师”，教师必须了解学生身心发展的规律，具备维护学生心理健康的能力。未来的社会中，教师心理健康教育的专业化水平将有所提高。国家通过鼓励和引导继续教育，制定执教人员的专业标准，考核颁发资格证书，以及倡导高等学校相关专业的大力发展，将逐步建立掌握专业知识和技能的师资队伍。
（三）学校心理健康教育现代化
和社会其他领域一样，学校心理健康教育也将越来越多地使用现代化手段进行信息的传递、运用、储存和管理。信息技术、计算机的广泛使用，特别是计算机网络技术的应用，将使学生心理健康教育工作的管理、运行现代化。一方面，网络的覆盖面广，克服时间、空间的跨度及对信息处理的迅速、客观、准确性等特性远非人力可比。另一方面，21世纪网络将成为青少年生活学习不可或缺的伙伴，利用网络技术开展心理健康教育将扩大心理辅导的层面，成为提高心理健康教育成效的重要手段。网络技术在学校心理健康教育工作中将发挥以下作用：对学生各种心理档案的立档、储存、管理和运用；实行网上咨询，学生可以在网上进行心理测验或直接向专家咨询；在网上对教师进行专业培训；建立全国学校心理健康教育网络系统和心理咨询与治疗的专家系统，实现各地间的信息交流和资源共享。
（四）学校心理健康教育功能齐全化
如前所述，学校心理健康教育具有初级、中级和高级三层功能。初级功能，指治疗、消除学生已有心理疾病的功能；中级功能，指通过心理健康教育，使学生掌握自我心理调节的方法，达到预防心理问题的目的；高级功能则指通过心理健康教育使学生充分发挥自己的潜能，达到个体发展的最优化。学校心理健康教育始终坚持以达到这三级功能为目标，以实现高级功能为最终目标。现阶段，由于我国学校心理健康教育的发展还不成熟，一哄而上、良莠不齐，缺乏科学客观的评估、指导，使得学校心理健康教育尚未能很好地发挥其固有的功能。但是，随着社会、学校、家庭及青少年本身对开发心理潜能的了解和重视，学校心理健康教育的重心将逐渐向着促进人的全面发展和自我实现这一目标聚拢，学校将最大限度地集中教育的人力资源，给学生以更全面的影响。正如心理学家弗洛姆所说：“当今是个心理学的时代，心理学的新趋势是注重如何帮助健康的人发挥潜能。”从关注人的心理健康到关注人的心理潜能的开发，是心理学成熟的标志，也是学校心理健康教育成熟的标志。