在印加遗迹中，最著名的就是“马丘比丘”。它坐落在秘鲁库斯科城西北110千米处，一座海拔2458米的山巅上。在克丘亚语中，马丘比丘意为“古老的山顶”，它是世界七大古迹之一。
马丘比丘城堡自从古代的巴比伦空中花园颓圮之后，就将这座高踞在秘鲁安第斯山脉群峰之间的什加送城递补上了，又称为“高空城堡”。马丘比丘的两边是悬崖峭壁，山下激流湍湍，地形十分险要。早在公元前，印加人就在这里休养生息，创造了灿烂的文化。后来不知何故，昌盛一时的古城竟变成一座空城，淹没长达400多年，不为人们所知。直到1911年，美国耶鲁大学历史教授海勒姆·宾加曼只身攀登上险峭的悬崖，马丘比丘才像一颗深埋已久的珍珠，以耀眼的光辉展现在人们面前。马丘比丘及其所在地区的其他古建筑几乎都是在公元15世纪建造的，那时正是印加帝国开始扩张，由巴恰古蒂统治的时期。整座城堡坐落在乌鲁巴姆巴河两座绝峰中间的一座较矮平削的山峰盆地上，四面山峰环立如屏障，站在城堡上，好像一伸手就可以触到群峰巅似的，难得一见。由于所处的地理位置特殊，它成为印加王朝最隐藏地。这里有古城墙、平台和岩石上凿出的巨大斜梯，一切都宛如大自然的延续，所有建筑都与其所处的自然环境融为一体。
马丘比丘城郭用巨大的花岗石建成，迤逦壮观，气势磅礴，宛如一道屏障，故有“秘鲁长城”之称。它总共包括近200座建筑和109个连接山坡和城市的总共3000级台阶，其中有些台阶在岩石上凿成。城内的街道虽不宽敞，但整齐有致，石门石巷，曲折非常。迷宫似的神殿、王宫、住宅、院落错综其间，在所有建筑中，军用塔楼、御苑、公主宫、要塞群、神圣广场、宏大寺、三窟寺及印地华塔纳寺最为精美。房屋建造全用巨大的石块堆垒而成，每一块都是论吨计的巨石。磨工是那样准确，所砌成的圆弧度是那样的圆滑，尖的角度也是恰好地一层一层尖削上去。石与石之间，没有任何黏合物，但是黏合得紧密到想用小刀插进也难。窗户均呈三角形，顶端仅置一块石头。街道上有石头铺的渠道，作供应居民饮水之用。这是一条暗渠，渠道由上下两条半圆形的石头扣合起来，像竹节一样一节连着一节。流水的孔洞并不大，但石槽吻合得非常严密，再加上地面盖上石板，便形成一条密封的地下水渠。不仅保持了水的清洁，也减少了蒸发。这样聪明的设计，在当时的条件下应该说古代印加人的头脑是很不简单的。马丘比丘城堡的立柱宽阔的“神圣广场”中央，竖有印加人用以测定时间的巨大日晷。印加人尊崇太阳神，据说城中巨大的太阳神庙，完全由未婚少女管理。在高山之上，伫立着“拴日椿”，这是唯一一块。值得注意的是这些木乃伊中百分之九十以上是妇女。这就证实了此处不可能是军事重镇，而可能是供奉太阳神的童女庙。根据印加人的习俗，他们为了崇拜太阳神，往往从贵族家庭中挑选一些才貌出众的女孩，送进童女庙专门来供奉太阳神，她们终身在此隐居，死后就葬在这里。而那些少数的男子则是为她们的圣职服务的。
证明马丘比丘可能是神庙的另一根据，是它城堡的正门就叫太阳门。这些城门遗迹，建筑精巧而又雄伟。城内有些广场和建筑，看来是举行大型宗教活动和进行祭祀的地方。而北面一个较小的山峰，在克丘亚语中叫做青年峰，它的背面有一座月亮神庙，和这里的城堡遥遥相对，从此也可以断定马丘比丘确实是供奉太阳神的地方。
马丘比丘是秘鲁古代文化的一颗瑰宝，巧夺天工的宏伟建筑凝聚着印加人的勤劳和智慧，在世界建筑史上占有十分重要的地位。为此，联合国教科文组织宣布它为人类最重要的文物遗址之一。马丘比丘又是一座充满神秘色彩的城市，至今仍有许多不解之谜。自从宾加曼发现古城遗址以来，世界各国学者纷至沓来，对古城继续进行研究和发掘文物。秘鲁政府为了利用古迹发展旅游，特地从库斯科修建一条通往古城山脊下的铁路，很多游客为领略印加古城的雄姿不远千里前来猎奇观光，使得这座荒凉的古城变成了秘鲁的一个引人注目的旅游胜地。