泥鳅孵化过程实际上就是胚胎发育过程。泥鳅卵呈圆形，直径0.8毫米左右，受精后因卵膜吸水膨胀，卵径增大到1.3毫米。几乎完全透明。成熟卵弱黏性。卵球分化有动物极和植物极。动物极为原生质集中多的一端，也就是泥鳅胚胎存在的位置；植物极为卵黄，也就是营养物质集中的一端。当水温19.5℃，从动物极原生质隆起形成胚盘似帽状，约占卵球高度的1/3，胚盘经细胞分裂进入桑椹期历时7小时15分钟。之后历经囊胚期、原肠期、神经胚期、肌节出现期、尾芽形成期，这时器官逐步形成，眼囊、嗅囊、尾芽、耳囊、尾鳍褶、晶体，耳石相继出现，心脏原基开始有节律跳动，心率约48次/分。经48小时45分钟，胚体剧烈扭动，泥鳅苗从卵膜内孵出。泥鳅胚胎发育速度与水温密切相关，在一定温度范围内，泥鳅胚胎发育速度随水温增高而加快。泥鳅苗从开始出膜直至全部出膜所需时间也和水温有关。
