年少气盛的李治自然不会轻易罢休，这时他已下定决心，要除掉随时牵制他的一帮老臣，因为随着柳爽向长孙无忌等人的靠拢，王皇后已经逐渐成为唐高宗和元老重臣们相争的焦点，所以李治要废掉已成为自己对立面的王皇后。李治主意已定，便召集众大臣商量废后之事。褚遂良坚决反对，李治就马上贬他为潭州都督。长孙无忌也多次上书谈到不能立武后，李治先是拉拢他，秘密派人赐给他金银珠宝，但是长孙无忌不领情，李治先是贬他到黔州，接着又派人去审问他的案件，最后认为长孙无忌要谋反，就下令让他自尽了事。王皇后被废之后，没有得到善终，下场十分凄惨。废黜皇后事件的背后，其实是一场惊心动魄的政治斗争，王皇后作为这场斗争中的一枚棋子，成为了宫廷斗争的牺牲品。
权力对决，舅甥的恩怨较量
长孙无忌可谓是唐朝初年的风云人物，从唐高祖李渊开创大唐，到唐太宗李世民喋血玄武门，再到唐高宗李治顺利即位，都浸润着长孙无忌的智慧和谋略。长孙无忌作为李世民之妻长孙皇后的哥哥，李治的亲舅舅，对大唐算是忠心耿耿的，因此也备受这三任皇帝的礼遇和厚待。李渊在位时，封他为齐国公。李世民临死前对大臣们说“我能拥有天下，长孙无忌有很大功劳啊。”李治即位后，封他为太尉，同中书门下三品。
作为唐太宗的第九子，李治除了嫡子这一优势外，性格柔弱的他能当上皇帝，全靠舅舅长孙无忌从中周旋。唐高宗在位期间最大的政治事件，莫过于废黜王皇后了。李治虽然比较懦弱，性格温和，但在废掉王皇后，改立武氏为皇后的问题上却相当果断。为了铲除阻挠自己立新皇后的障碍，李治找了各种原因杀掉了那些持反对意见的大臣们。
但是对于血脉相连的亲舅舅，李治不敢轻举妄动、狠下毒手，所以先是试图拉拢他。李治秘密派人赐给长孙无忌一车一车的金银珠宝，还给长孙无忌的儿子封了官，但是长孙无忌就是不领情，还给前去办事的人一个白眼。李治知道后，心中十分恼怒，舅舅长孙无忌这种油盐不进、不近人情的冷漠态度深深地刺痛了他的心。李治虽然老实，但他毕竟是至高无上的皇帝，他决定的事，谁出来反对都是螳臂当车。正巧这时，李勣对李治说：“立谁当皇后，那是皇帝自己的事，别人何苦来添堵呢？”这番话简直说到了李治的心坎里，有人赞成自己的想法，唐高宗李治毅然决然地废黜了王皇后，立武昭仪为新皇后。
木已成舟之后，李治并没有就此罢休，对于那些之前一直反对他废后立后的大臣们，他开始了秋后算账。褚遂良被数次降职，韩瑗、来济被贬到边州永不许进京，于志宁、柳爽被彻底免职。在这场政治风波中，产生了两派针锋相对的政治势力，即以许敬宗、李义府等人为代表的支持派，和以长孙无忌、褚遂良等人为代表的反对派。许敬宗、李义府等人虽然在政治上比较失意，但他们善于见风使舵，看到李治对武则天的眷恋之情，便投奔到武则天麾下，为武则天当皇后摇旗呐喊。长孙无忌、褚遂良等人是一批元老重臣，功劳大、根基深，从内心里反对出身寒微、当过尼姑、心狠手辣的武则天当母仪天下的皇后。两派之间的实力悬殊，胜败很容易分晓，但是当李治铁了心非要立武则天为皇后时，胜败就已经注定了。
长孙无忌的羽翼被一个个剪除了，他见识到了李治的厉害。通过册立新皇后的成功，李治领略到了皇权的所向披靡，心中十分得意。因为当皇帝的这些年来，李治一直生活得比较郁闷，好多事情都是由舅舅长孙无忌替他操办的，无论自己多么努力，做了些什么了不起的事情，都会被父亲唐太宗李世民的影子笼罩，比如令他颇为得意的“永徽之治”，也被看作是“贞观遗风”。李治不想一辈子活在唐太宗的光环中，他不想自己的功绩被掩盖，更不想处处掣肘于长孙无忌。尤其是随着年龄的增大，那种独揽朝纲的信念就越来越强烈，那种想要摆脱控制的意愿就越明显。废立皇后成了李治和舅舅长孙无忌之间矛盾激化的焦点。尽管长孙无忌现在失去了羽翼，但是他在朝野纵横了多年，影响力依然举足轻重。所以李治清楚，要想自己一言九鼎，就必须要除掉舅舅长孙无忌。
但是唐高宗李治一向以仁孝著称，长孙无忌作为自己的舅舅，毕竟是长辈和亲人，他还是狠不下心来对亲舅舅实施生杀大权。但是机会总会有的，在皇权专制的制度下，谁要是沾上了谋反的边，无论是皇亲国戚，还是宗室王公，统统没有好果子吃。
显庆四年(659年)，中书令许敬宗为了迎合唐高宗李治，派人上奏称监察御史李巢与长孙无忌谋反，朝野一片哗然。对于这件事情，李治先是表现得非常吃惊，紧接着又表现出很难过的样子。可他既没有找来长孙无忌当面对质，也没有做出任何的调查取证，就把亲舅舅发配到了黔州。三个月之后，李治又派人复查此案，长孙无忌被逼自杀，享年六十三岁。
长孙无忌死后，朝中再也没有人能与皇后武则天抗衡了。于是，武则天开始染指朝政。唐高宗李治逼死了自己的舅舅长孙无忌，为的就是独掌朝廷大权，但哪里想的到，最终却被自己心爱的皇后武则天将权利架空了，在这场舅甥的争斗中，落得个鹬蚌相争渔翁得利的结果。
帝后争锋，拱手让江山
唐高宗李治在册立武则天为新皇后的一段时间里，心情非常好，因为皇后不仅端庄美丽，而且对自己百依百顺、小鸟依人，这正是他心中理想的皇后形象。显庆五年（660年）之后，高宗经常头晕目眩，两眼模糊，影响到了政务的处理。因为皇后天资聪慧，所以李治让她帮着自己处理政务，武则天乘机插手政治，开始参与国家大事，还拉拢了一批心腹之臣。
刚开始，李治见皇后把政务处理得井井有条十分欣慰，也对她非常放心。但是慢慢地，武则天开始控制李治，李治的一举一动都被武则天的眼线监视着，李治察觉出皇后有了主导政局的趋势，甚至一度产生了废后的打算。但是没想到的是，他的计划竟然被武则天知道了。武则天是何等聪明之人，他太了解自己这位软弱的丈夫了，于是装作柔弱的模样，眼中带泪地向李治解释说：“陛下，臣妾只是见你身体欠佳，十分担心，才时时派人跟着您，并不是想要监视和控制，臣妾冤枉。如果您觉得把政务交给臣妾协助不放心的话，臣妾可以不管，还可以落得个清闲，臣妾只是想替您分忧，现在却被自己的夫君怀疑，被别人说三道四。”李治看着梨花带雨的皇后，心又软了下来。于是事情就这样结束了，但是协助李治拟诏废后的上官仪却被武则天怀恨在心，落得个灭族诛杀的下场。
武则天逐渐掌握了朝政，李治在她的建议下使用天皇称号，与天后武氏并称“二圣”。武则天为了取得政权，想尽一切办法显示自己的政治才能。她向李治提出了建言十二事：“劝农桑，薄赋徭；给复三辅地；息兵，以道德化天下；南北中尚禁浮巧；省功费力役；广言路；杜谗口；王公以降皆习《老子》；父在为母服齐衰三年；上元前勋官已给告身者无追核；京官八品以上益禀入；百官任事久，才高位下者得进阶申滞。”这十二条建议涉及的范围很广，与政治、经济、军事、社会各方面都有关系，可见武则天确实有相当的政治才能。
上元二年（675年），李治患的目眩症更厉害了，很难再处理朝政，便与大臣们商议，准备让武则天正式摄政。宰相郝处俊说：“陛下，您为何不将高祖、太宗的天下传给子孙呢？委任给天后并不可行啊。”李治听后觉得有些道理，所以暂时停议。武则天知道后，召集了一些文学之士撰写《列女传》、《臣轨》、《百僚新戒》、《乐书》等千余卷书籍，密令参决百官疏奏，以分宰相的权力。虽然李治和武则天共同商议政务，但是李治仍掌握着实权。在他执政期间，武则天的支持者先后倒台，她的政敌受到了李治的任用，拟定《内训》和《外戚诫》等，用来压制武家人兴风作浪，武则天对此十分气愤，但又无可奈何。
武则天当上皇后并不满足，她废掉了以前的太子李忠，将自己的亲生儿子李弘立为太子。但是因为李弘为萧淑妃的女儿求情，引起了武则天的不满。后来，李弘忽然死了。武则天又立了自己的第二个儿子李贤为太子，李贤喜欢练武，天资聪明，李治非常喜欢这个儿子。但是武则天对权利非常的渴望，所以她担心李贤会成为自己掌权的一个障碍。于是，她找了个借口将自己的儿子李贤贬出了京城，后将他赐死。武则天最终决定将儿子李显推上太子之位，这个儿子生性庸懦，可以成为一个很好的傀儡。
永淳二年（683年），李治移驾奉天宫。当时武后从泰山封禅以后，劝李治封中岳，李治因患病而终止。李治苦于头痛，每天痛苦不堪，侍医秦鸣鹤说：“把头微微刺出血来，可以治愈头疼。”武则天听后，在帷帐中对侍医说：“你竟敢在陛下头上刺出血来，真是大胆，应该拖出去斩了！”李治说：“我苦于头痛，刺出血未必不好，没准真的管用呢，还是试一试吧。”侍医就用针刺李治的百会穴，过了一会，李治说：“我的眼睛好像变得明亮了。”但是过了不久，李治的病情还是加重了，他诏命皇太子李显代理国政，让裴炎、刘齐贤、郭正一等人在东宫任同平章事。
尽管唐高宗将皇位传给了太子李显，从表面上看，似乎保住了李氏江山，但是当时朝廷的政权已经被武则天架空了，所以传位给李显也改变不了实质问题。李治从一开始的废黜王皇后、册立武皇后，就走错了棋，到后来让武则天协助自己处理政事，委政于武后，更是错上加错，无异于拱手让江山。
同年十二月，李治诏令改永淳二年为弘道元年，将要宣布赦免之书。他想亲自到则天门楼，由于气不顺而不能上马，于是召集百姓在殿前宣读赦免书。礼毕，李治问侍臣：“百姓高兴吗？”侍臣回答：“百姓承蒙皇上赦免，全都感激涕零、欣喜若狂。”李治说：“百姓虽然高兴，但是我的性命是不久了，如果神灵能够延长我一两个月的生命，让我能够回到长安，那么我死也没有遗憾了。”但是事不遂人愿，当天晚上，李治就在贞观殿去世了，终年五十六岁，谥号天皇大帝，庙号高宗，安葬在乾陵。