在水田使用除草剂常要求保持一定时间的水层，保持水层的作用主要在于使除草剂分布均匀和有利于被植物吸收，对于一些蒸气压较高的除草剂，保水方能减少其挥发损失。过早脱水会影响药效，漏水田效果更差。但是如遇大雨，田间积水过深，淹没心叶，又会产生药害。因此用药后必须做好“平水缺”，以保持适当的水层深度。在旱地使用土壤处理剂，一般均要求有高的土壤湿度，才能很好发挥药效。在干旱的情况下，施入土壤的除草剂往往大量地被土壤胶体牢牢吸附，不能发挥作用；而在土壤湿度充分的情况下，却能起解吸附作用而将除草剂释放出来供植物吸收。但是，土壤湿度也不是越大越好，当湿度过饱和甚至积水时，许多除草剂会淋溶到土壤下层作物的根部，引起药害。因此田间须有良好的灌排系统，既可在干旱进沟灌涸水，又可在水分过多时及时排水降渍。
