带有界膜的原始生命出现后，由于地球温度仍很高又严重缺氧，这些原始生命的存在受到很大威胁，它们只能生活在海洋中。后来由于大自然的雷电和太阳紫外线的作用，产生了大量的臭氧。逐渐在地球表面形成了臭氧层，臭氧层的形成为原始生命的存在与进化创造了条件。大约在40亿年以前，经过漫长的演化，原始生命内部构造也发生了复杂变化，逐渐产生了细胞。细胞的出现，原始生命的化学进化就转变成生物进化了。细胞的出现，是生命形成的标志，是生命进化史上的又一次质的飞跃，但原始细胞还没有真正的细胞核，大约在15亿年前，地球上才出现了具有真正细胞核的真核细胞。
细胞的形成，意味着生命的形成。地球是生命的源头。从地球表面有机化合物的形成，到生物的化学进化出现细胞，这只是生命的形成，生命形成后，生物进化并没有停止。带有界膜的原始生命经过漫长的进化成为细胞后的进化，就是生物进化。从原始的单细胞生物逐渐演化为多细胞的生物以至最高等生物的整个历程都属于生物进化阶段。生物的化学进化是生命的起源，要研究生物的进化必须首先从生命起源着手，研究生命的起源对于研究生物的进化有着决定性意义，只有从生命起源着手，才能彻底粉碎唯心主义的神创论，才能解开生命之谜。
生命是由于化学进化形成的，这已被科学证明。在现代科学中，用模拟原始地球条件的方法，在实验室内用简单的无机化合物和有机化合物合成复杂的高分子化合物。由此可以判断出从无机物转化为有机物是可能的。从有机小分子向类似蛋白质和核酸高分子化合物的转化也是可能的。自然界从无机走向有机，从有机的化学进化而形成生命也是可能的。这也是合乎自然规律的。如美国学者米勒在1953年用甲烷、氨水、蒸气等，通过火花放电成功地合成氨基酸。一些国家的科学家已经制造出类似蛋白质和核酸的物质。我国科学工作者在1965年就成功地合成结晶牛胰岛素。这种人工合成的蛋白质含有51个氨基酸。
从大量的化学试验来看，生命起源有四个阶段。
第一阶段：从无机小分子物质生成有机小分子物质，这主要是因为地球火山造地运动后，原始地球由原来炽热的球体开始冷却，地表大气中有大量的氨、水蒸气、二氧化碳等：由于没有游离氧而合成为有机小分子物质。这一阶段有三个合成过程：1.地核喷出的碳化物＋水蒸气→碳氢化合物。如甲烷、乙炔等。
2.碳氢化合物＋水＋氨，在适当的温度下生成更加复杂的有机物，如氰化氢等。
3.甲烷、氨、氮、氢、水蒸气、二氧化碳、氰化氢等混合物在外界宇宙射线、紫外线、闪电等高能作用下，逐渐形成氨基酸、单糖、核苷酸等生命必需的原生质。
第二阶段：从有机小分子物质形成有机高分子物质。
在第一阶段生成的小分子有机物通过雨水作用，经由江河湖泊汇聚海洋，这些有机物的不断积聚增多，慢慢发生化学变化。
氨基酸——经过综合作用——生成原始蛋白质分子。
核苷酸——经过长期的聚合作用——生成原始核酸分子。
第三阶段：从有机高分子组成多分子体系。
在海洋中形成的蛋白质和核酸分子由于没有生物的消耗而越聚越多。这样，有机高分子由于多种原因和浓缩作用，聚集的有机高分子物质就形成了团聚体或微球体。
第四阶段：从多分子体系演变为原始生命、有机体。
现代科学目前还不能人工合成细胞，但已能合成细胞的生命物质。由此可以推论，生命体是由多分子体系经过长期的化学进化形成的多分子体系的原始新陈代谢作用和繁殖才形成原始的生命物质。
生命起源于地球变化而引起无机物向有机物的化学进化，有机化合物的长期化学进化才出现了生命。这就彻底粉碎了唯心主义的神创论，也有力批驳了生命自发论的错误观点。