所谓双孢菇的生活史，是指从双孢菇孢子萌发形成菌丝，菌丝扭结形成子实体，子实体成熟后再产生新一代孢子的整个发育过程。了解双孢菇的生活史不仅是进行双孢菇育种的基础，同时也对栽培生产具有指导意义。
与其他伞菌相比，双孢菇的生活史更为复杂。双孢菇的95％的担子上只形成2个而不是4个担孢子，4.5％的担子上产生3个担孢子，只有0.5％的担子上产生4个担孢子，这样就形成了担孢子核相的多样性。从生活史图上可以看出，含有异核双核体的担孢子占63％，这是自体可育的担孢子，它们萌发后可以发育成为可育菌丝，这也是双孢菇通过单孢分离选育优良品种研究的基础；而形成同核双核体的几率也较高，约为33.5%，形成单核担孢子的几率为3.5％，这两类担孢子是自体不育的担孢子，其萌发后必须通过具有亲和能力的单核菌丝进行质配，才能形成可育菌丝。综上所述，育种过程中通过单孢分离获得的双孢菇菌株大约有1／3根本就不能形成子实体，这也就是单孢子菌株必须经过出菇试验后才能用于生产的原因。