康熙即位之后，为了维持国家稳定，让人民过上宫足的生活，采取了一系列政策，平定三藩、收复台湾和改善民生，让大清朝迎来了辉煌的时期。
康熙八岁即位，当时中国经济衰落、国弱民贫、朝内部分大臣专横、南方藩王各自做大、台湾自立天下，政治局面极其不安定。
康熙稍大之后，在孝庄太后的辅佐和指导下，先安朝廷，消灭鳌拜势力，收回权力，稳定了朝廷内部局势。接着集中精力对付号称“三藩”的吴三桂、尚可喜和耿精忠，历经八年战争，终于平定了南方实现了大陆统一。随后，乘着大战告捷的余威武力挺进台湾，最终收复了台湾列岛。招抚台湾是一场军事战斗更是一场智斗，这场战役充分显示了康熙的大智慧。
康熙元年（1662年），郑成功率军驱逐荷兰侵略者收复台湾不久即病逝，享年三十八岁。郑成功死后，台湾当局发生内讧。清廷得知消息后，立即派使者与郑氏集团谈判，希望郑经能够臣服朝廷，统一台湾。郑经觉得归顺朝廷是一个平息内乱的办法，便派人与清政府谈和，并向清政府交出了南明皇帝赐给的敕书、印玺，因为郑经拒绝了清朝对郑氏族人迁回大陆、接受清朝的风俗礼仪而改变服饰习俗的要求，所以这次谈判未能成功。
康熙二年（1663年），清政府派兵攻打厦门，厦门是郑家在内地的最后一个据点，厦门的攻克迫使郑经退出厦门而逃亡台湾。清政府本想乘着胜利一路追击，却因海上的台风沉没了军队的船只，只得停下追击。清王朝以撤藩为头等大事，再加上经济力量不富裕，故而无力用兵台湾战局。
当时台湾刚刚发展农业，岛内人口甚少，生产相对落后，经济比较贫困，粮食和许多物质都得依靠大陆供应。郑经旧部多是福建人，他们离家远赴台湾遭此困境，大多思恋故乡，军心极其浮动，偷渡回归大陆者络绎不绝。
康熙六年（1667年），清政府派总兵孔元章去台湾招降，承诺如果郑经愿意归顺清朝，就封他为“八闽王”。郑经为此犹豫考虑了很长时间，最后回答：“不能把求和作为长久之策，先父的遗志不可以放弃。”因此拒绝了清政府的这次招降。
康熙亲政后，下旨让刑部尚书明珠去福建负责议和的事情，明珠派知府慕天颜前往台湾再次招降。这次招抚过程中，清政府做了很大的让步，答应册封郑经为藩王，郑家一族世代留守台湾。郑经提出要仿照朝鲜那样，不用削发换衣，成为大清的附属国，向大清进贡的要求。
康熙回答说：“如果郑经离不开台湾，可以考虑与其方便。但是，相比于朝鲜那样不用削发、称臣进贡的想法不能答应。朝鲜一直是外国，但郑经却是中国人。”康熙不愿意台湾从中国分离出去，所以这次谈判未能成功。
此后吴三桂造反，制造了三藩之乱，致使中原战火四起，隐隐有天下大乱之意。郑经自以为驱逐满人的时机到来，便趁机与吴三桂、耿精忠勾结，占领了厦门与漳州、泉州、潮州、惠州各地。
经过数年征战，吴三桂病死疆场，吴世瑶自杀身亡，郑经孤军难支只得退回台湾。清朝又有了一次可以招抚的机会，这次郑经依旧提出台湾仿照琉球、朝鲜成为中国之外的国家。康熙依旧坚决不答应，在双方坚决坚持自己的立场和意见的情况下，谈判再次失败。
康熙二十年（1681年）三月，郑经病逝，其子郑克壤嗣位。清廷重新讨论如何解决台湾问题，其中反对武力攻取台湾的大臣颇多。康熙知道郑克壤年幼，无法决定重大政治战略，便力排众议，决定采用攻打和招抚并用的政策，“底定海疆”。
台湾岛处于海洋之中，汹涌的海涛，在其四周形成了天然屏障。所以，想要攻克台湾必须要有水军。但是清朝的将士大多只熟悉马，对水战并不熟悉，所以必须另外挑选熟悉水性的领兵将领来训练士兵，李光地和福建总督姚启圣推荐施琅担任水军的将领。
施琅，祖籍福建晋江，有勇有谋。早年是郑芝龙（按：郑芝龙是郑成功的父亲）手下的一员战将，后来，跟随郑芝龙投降清廷。施琅的族人被郑成功杀害，两人因而结下深仇大恨。施琅在福建和郑成功作战多年，经验丰富，熟悉各种军事事宜和海上的天气情况。施琅多次向清廷建议攻取台湾，清廷都不予理会。施琅早年身为郑成功的部下，因此没有获得清廷的信任。施琅一直被安置在北京，赋闲十三年。康熙帝决定启用施琅，授予其福建水师提督一职。当时，姚启圣是福建总督。两人齐心协力，施琅在前线指挥作战，姚启圣在后方专门负责粮草和物资的供应。