979年，唐朝在泉州东部设立了一个新的州，取名为兴化军。采取这个措施的理由，是为了有效控制福州附近山区的不安定局面。兴化军的治所最初设在与兴化军同时设立的兴化县城。原来由泉州管辖的仙游和莆田两个县，不久之后划归兴化军管辖。由于莆田县城的位置极具战略意义，数年之后，兴化军的治所迁至莆田县城。同时，莆田县城所具备的经济功能也是影响这个决策的重要因素。
从闽国末期开始，闽南地区县的数量也增长了两倍，至10世纪末，闽南地区县的总数达到了14个，这一时期新设的县多达7个，其中有5个归泉州管辖。
地处泉州和漳州之间的同安县设立于939年。同安县城之所以重要，不仅因为它是控制泉州和漳州关系的纽带，而且还因为它和漳州城共享漳州湾作为出海口。在此之前，一个名为德化的内陆县在闽江支流大樟溪上游设立，它地处泉州北部山区。933年，闽王朝决定把新设立的德化县从福州管辖的永泰县分离出来。然而10年之后，德化县却成为割据的藩镇留从效控制的一个地区。从此以后，德化县就划归泉州管辖，成为闽南地区的一部分。这个发展过程可以反映出大樟溪下游河段通航困难的问题。
在闽国灭亡前不久，另一内陆行政区永春县，也在泉州北部山区设立。尽管远离沿海，但永春县城可通过通航水路与晋江下游地区联系，因此它与泉州的往来不存在太大的困难。
在这一时期，泉州还设置了两个县。一个是955年设立的清溪县，1121年它被改名为安溪县。它的县城最初是个小集镇，坐落于晋江支流之上，通过通航河道与泉州相联系。在安溪县设立时，这里驻扎着2 000名禁军，还有2 000户人家。似乎它既是军事要塞，又是经济要地。另一个是惠安县，它是981年从晋江县的北部地区分离出来的，地处泉州城和兴化军城之间的沿海地带。
955年，留从效在离九龙江东岸不远的地方，设立了归漳州管辖的长泰县。由于县城离漳州城太近，所以在978年，闽南被宋朝直接控制之后不久，就归并到漳州的管辖范围之内了。