保存品种资源是为了提供育种工作的方便，绝不是单纯地为保存而保存，光保存不使用，那就失去了保存品种资源的意义。
一个原种种群存在着一个基因库，库里的基因分散地存在于群体内的各个个体中，包含有许多控制和影响该群体各种优良性状的基因。保存就要达到基因一个也不丢失，为此保留足够数量的个体是必要的，数量少了，这个基因库就不容易保存好。因为近交系数与繁殖群体的大小成反比，繁殖群体越大，近交系数随世代上升的速度越慢，对保种越有利。但由于经济和管理上的原因，不可能保存非常多的亲体。那么，为了保种，该有多少数目的群体才算合适呢？这里情况比较复杂，必须考虑各种制约因素，不能一概而论。据报道，在匈牙利，鲤鱼占其养鱼产量的60%以上。为了保护鲤鱼的种质资源，该国建立了鲤鱼种质资源库，含有13个匈牙利品系和12个欧洲品系。每个品系的群体大小维持在50尾（25尾雌，25尾雄）。我国鲤科鱼类繁育群体的大小宜保持在500尾以上（雌雄各半）。这样，一代随机交配的近交系数可不超过0.1%。
目前我国几种主要养殖鱼类不同地方品种、品系或种群的保存问题已相当突出，需要建立原种场（基因库）专门进行保种工作。保种方法有室内建池养殖保种和室外专池养殖保种等。这是在个体水平上的保存方法。另外，采用性细胞或胚胎冷冻保存（精子库、卵子库或胚胎库）和纯系细胞株的保存（细胞库）等也都是值得很好研究的种质资源保存的方法。