自1976年至1988年，全国累计种植杂交稻12．56亿亩，累计增产稻谷1000亿公斤以上，增加总产值280亿元，取得了巨大的社会效益。
荣获特等发明奖
1981年5月5日，国家科委发明评选委员会根据国务院颁发的《发明奖励条例》，对籼型杂交水稻这项重大发明进行认真的评审。
评选委员会根据《发明奖励条例》第七条，报请国务院批准，决定授予全国籼型杂交水稻科研协作组袁隆平等人特等发明奖，发给奖状、奖章和奖金10万元。
1981年6月6日，正值火热的夏季，国家科委、国家农委在北京联合召开籼型杂交水稻特等发明奖授奖大会。
大礼堂里，掌声雷动，花团锦簇。
这次授奖大会由国家农委副主任张平化主持。
国家科委副主任武衡在会上宣读了国务院给全国籼型杂交水稻科研协作组的贺电，贺电全文如下：
全国籼型杂交水稻科研协作组：
籼型杂交水稻是一项重大发明，它丰富了水稻育种的理论和实践，育成了优良品种。在有关部门和省、市、自治区的领导下，大力协作，密切配合，业已大面积推广，促进了我国水稻大幅度增产。
为此，特向你们并通过你们向参加发明、推广这项成果和参与组织领导工作的科技人员、农民、干部致以热烈的祝贺。
籼型杂交水稻的育成和推广，有力地表明科学技术成果一旦运用于生产建设，能够产生多么大的经济效益。发展农业生产，一靠政策，二靠科学。殷切期望广大农业科技工作者再接再厉，继续奋进，为发展我国农业生产做出更大的贡献。
国务院
1981年6月6日
在授奖大会上，国务院副总理方毅给获奖者颁发奖状、奖章和奖金，袁隆平代表全体从事杂交水稻研究的科技人员上台领奖。
在经久不息的掌声和鲜花的簇拥下，袁隆平十分郑重地从方毅手中接过奖状、奖章和奖金。
这时候，在困难面前从不低头的袁隆平，眼中闪烁着激动的泪花！
方毅在籼型杂交水稻特等发明奖授奖大会上说：“籼型杂交水稻的培育成功，丰富了水稻遗传育种的理论和实践，在国际上遥遥领先，为中国争得了荣誉。美国、日本、印度、意大利、苏联等10多个国家的科学家，开展杂交水稻的研究已有10多年的历史，但都还处在实验阶段，而我们是走在前面了……”
袁隆平在授奖大会上表示，要继续谦虚谨慎，戒骄戒躁，把荣誉当做动力，去攀登新的高峰。
1981年6月7日，《人民日报》头版头条报道袁隆平获奖的消息，同时发表了《争当攀登科学技术高峰的勇士》的社论。
社论高度赞扬以袁隆平为代表的科技人员发扬主人翁的责任感，埋头苦干，勇攀世界科技高峰，为国争光的精神。
1984年，湖南杂交水稻研究中心成立，袁隆平担任主任，他成为湖南省乃至全国杂交水稻科学研究的核心人物。
在袁隆平的率领下，杂交水稻科研队伍齐心协力，加快了杂交水稻研究的步伐。
两系法列入科技计划
进入80年代以后，袁隆平不断在国内和国际上获得巨大的荣誉，但他并没有被这些殊荣冲昏头脑。袁隆平十分清醒地认识到：科技发展永无止境，科技界的竞争日益激烈，要想保持杂交水稻研究的世界领先地位谈何容易！
因此，袁隆平在获得成功之后，仍然在农业科学领域进行着孜孜不倦的探索。他不仅没有像美国朋友威尔其所说的那样，去“盖一所王府好好享受一番”，就连星期天，他都没有好好休息过。
1986年11月，中共中央和国务院批准《高技术研究发展计划纲要》，简称为“863”计划。
这是一个关系到国家前途和命脉的重大科技发展计划。水稻两系法亚种间杂交优势利用技术研究，被国家正式列为其中的生物工程项目中的第101－1号专题，袁隆平被国家指定为该专题组组长和责任科学家。
从此，水稻两系法亚种间杂交优势利用技术研究在原已被列为同家自然科学基金重点课题，和国家“七五”科技攻关课题的基础上，再一次获得国家重点计划保障。
此时，袁隆平感到自己肩负的任务很重，压在他肩头上的，不仅有要使国家在21世纪的挑战面前站住脚跟的历史责任感，还有第三世界国家的那些饥饿的人们的呼救声……
从此，袁隆平工作起来更加废寝忘食了。
1987年，袁隆平发表《杂交水稻育种的战略设想》这篇论文，他在论文中提出“三系法品种间杂种优势利用、两系法亚种间杂种优势利用和一系法远缘杂种优势利用”这样三个战略发展阶段。
与此同时，袁隆平亲自主持“水稻两系法亚种间杂种优势利用”课题。
除此之外，袁隆平还牵头组建两系法杂交水稻协作组，开展全国性的协作攻关。
袁隆平在多次实验的基础上，几度调整研究方案，使得两系法杂交水稻研究得以顺利进行。
攻克两系法的难关
所谓两系法杂交水稻育种，是在过去的三系法杂交水稻育种的基础上提出来的。
在过去的三系法杂交育种材料中，由于不育系自身不能繁殖后代，故必须有个保持系跟它杂交，才能使它代代相传，并拿出大部分不育后代来和恢复系进行杂交制种。
现在，中国育种专家已经发明广光、温敏核不育系，当它在长日照下表现为雄性不育时，直接用恢复系与之杂交，就可以配置出任意多的种子供大田生产，而当它在短日照下表现为雄性可育时，它自己就可以自交结实，繁育出同样具有可两用特性的后代。这样，就不再需要保持系。三系就自然而然地变成两系。
袁隆平知道运用两系法杂交制种，有许多的优势，他说：“不育系与恢复系配组自由，有利于迅速测配出更多的优势组合供大田生产使用，可以克服三系法中存在的某些负效应，生产程序大大简化，种子成本必然降低，更有利于推广应用，发展前景十分广阔……”
因此，袁隆平十分重视两系法杂交制种的研究工作。
因此，光敏核不育水稻的研究，1985年就列人了国家自然科学基金项目。此后，又在全国各有关科研机构和大专院校普遍展开。
然而，几年下来，无论是袁隆平，还是全国各地其他科技人员的实验研究，都没有得到理想的应用结果。袁隆平认识到单纯利用农垦585这个种源进行试验研究，具有很大的局限性。
袁隆平在苦苦思考着。他认为不能在一棵树上吊死，必须另行找到更多新的光、温敏核不育种质资源，才会有更为广阔的试验天地，才有可能获得成功。
这时候，袁隆平忽然想起当年在海南发现野败的事情，他忽然有了一个奇妙的主意。
袁隆平立即发动“863”计划101－1专题组全国各协同单位和安江农校，在继续利用农垦585进行转育试验的同时，展开寻找新的光、温敏两用核不育种质资源的“大搜捕”行动。
果然不出袁隆平所料，1987年7月16日，一个叫邓华凤的科研人员按照袁隆平的指导，终于找到了新的光、温敏两用核不育种质资源。
后来，当袁隆平来到现场时，邓华凤是这样向他汇报的：
我过去也一直在用农垦585进行转育实用不育系的试验，但总是不能如意。去年听了您的指导后，我就把精力转移到寻找新材料上来。
今年7月16日，我终于在我们的籼稻三系育种材料中，找到一株雄花败育的突变株，我立即将开花的稻穗套袋隔离，而让没抽穗扬花的分蘖继续自由生长。
现在，打开套袋，可以看到这些在高温长日照时期开花的稻穗，全都没有自交结实；而这些更晚抽穗，在低温短日照期间开花的分蘖上的稻穗，则全都自交结了果。
因此，我判断，这株不育突变株，是一株受光、温条件控制的籼稻核不育株，它是农垦585之外的又一种光、温敏核不育材料。不知我的判断是否正确……
袁隆平听完邓华凤的汇报，十分高兴地肯定了他的成绩。
1988年7月，有关人员终于确证邓华凤找到的这一育种材料，在安江盛夏高温和长日照条件下，不育株和不育度都达到100％，保持不育的期间长达50天以上。而在这50多天之前或之后抽穗开花的，则全部表现为雄性可育，可自交结实。可见它确实是一种育性受光、温条件控制的宝贵的两用光、温敏核不育系。
7月26日，湖南省科委在怀化市举行隆重的鉴定会，袁隆平亲自主持。
与会专家一致认定邓华凤发现的不育材料完全达到了两用光、温敏核不育系的各项标准，鉴定一举通过。
袁隆平亲自将该不育系正式命名为“安农S－1”光、温敏核不育系，并指出它将在今后的两系法实用性杂交育种中发挥重大作用。
接着，袁隆平再一次向他的新生代助手邓华凤表示热烈的祝贺。
1988年，显然是两系法亚种间杂交育种小项研究突飞猛进、硕果累累的一年。两系法杂交育种的发展形势比三系突破初期要红火得多，胜利似乎已是指日可待。
然而，就在这时，意想不到的事情发生了。
1989年，长江中下游及其以南地区出现盛夏异常低温情况，致使该广大区域内的一系列已经通过鉴定的光敏核不育系全部发生育性反复。也就是说，应该是雄性不育的时候，它变得可育了，使杂交制种无法进行。
广西一家科研单位无视科学规律，冒险杂交制出一批种子，1990年投放大田生产10万亩，结果由于种子不纯，造成重大的经济损失。
这给光敏核不育系的定义和利用光敏核不育系进行两系法制种，带来意想不到的困难。
首先是光敏核不育系的定义问题。许多人开始质疑光敏核不育系的定义。不少人原先以为光敏核不育水稻的育性主要受日照时间长短影响，即对光敏感，但现在无情的事实证明，没有一种已经通过了鉴定的光敏核不育系是主要受光照影响的，它们其实全都是主要受温度的影响，即对温度敏感。
大家开始明白这样一个道理：所有的光敏核不育系其实都是光、温敏互作型的核不育系，还有个别甚至完全只受温度控制，而对光照毫无反应。
针对这种情况，袁隆平建议将习惯上称为“光敏核不育系”的名称改为“两用核雄性不育系”，再在其下分为光敏和温敏两个基本类型，以便准确地表示它们的定义。
其次是利用光敏核不育系进行两系法制种的问题。
如果光敏核不育系能像它的习惯名称所显示的那样，主要受光照影响的话，那么，在通过测配解决优势组合问题之后，它的应用就不会存在任何问题。因为地球上每个地方每年各季节的日照时间长度都是固定不变的；因而不育系的不育期一旦测定，也就应该不会改变。以后每年的这段期间，它都应该能保持最佳的不育状态，只要把握好在这段期间抽穗扬花，就可以安全地进行杂交制种。
可是，事实并非如此。事实上光敏核不育系的育性主要由温度决定。即使是在同一个地方的同一个季节，每年的气温也会有一定的差异。这就使主要对温度敏感的这种不育系的不育期，每年都会发生一定的变化，因而变得叫人无法准确把握；如果遇上异常低温年，甚至可能会发生不育期消失的严重危险。而1989年所遇到的，就是这种情况。
整个杂交水稻育种界因此掉进大自然设下的这个陷阱。人们一时间议论纷纷。
有些人开始对两系法杂交失去信心，也有一些人主张淘汰现有的温敏型不育系，争取选育出最少是一个纯粹受光照条件控制，或者最起码是主要受光照控制的光敏型不育系，然后才有可能使两系法制种进入实际应用阶段。
面对大自然的无情重击，面对人心惶惶的不利局面，作为“863”计划水稻两系法亚种间杂交育种专题组的责任专家，袁隆平一点儿也没有惊慌。
袁隆平态度冷静地听取各方面的意见，然后认真地进行思考。他还告诉大家，悲观失望是没有好处的，而积极进取也必须站在可能的基础之上。
袁隆平说：“根据我们多年的实践来看，那种试图完全淘汰现有的温敏不育系，选育出纯粹的光敏不育系的想法，几乎是不可能实现的，即便可能，也必将是遥遥无期。因此，比较便捷可行的办法，只能对现有的两用核不育系进行性能改良，使它们克服影响实际应用的某些性能局限，以求得快速突破。”
接下来，袁隆平仔细研究长江流域有记录以来的所有气象资料，结果，他发现该地区盛夏最低日平均气温从没有低于过摄氏24度。因此，袁隆平得出这样一个极具科学价值的结论：只要从现有的两用核不育系中，转育出若干个不育起点温度不高于摄氏24度的新型核不育系，就可以保证在长江流域及其以南的任何地区安全地进行杂交制种。
袁隆平的思虑十分周密，除了平原、丘陵地区之外，他还布置工作人员在海拔200至2000米的山区不同高度上设立多个实验点，同时展开转育试验。
最后，袁隆平经过郑重考虑，把培育出不育起点温度在摄氏24度以下的两用核不育系的任务交给自己的得意弟子罗孝和。
袁隆平笑着对已成为高级研究人员的罗孝和说：“现在，我交给你一项重大任务。你给我尽快培育出一个不育起点温度在摄氏24度以下的两用核不育系来，成功有奖。”
罗孝和愉快地接受了任务，迅速投入到紧张的培育工作中。
就这样，在袁隆平的带领下，广大科研人员经过不懈的努力，终于攻克两系法杂交水稻研究这个难题。
1995年，袁隆平郑重地向世界宣布：“两系法杂交水稻研究基本成功。”
在袁隆平两系法杂交育种理论的指导下，两系法杂交高粱、两系法杂交油菜、两系法杂交棉花、两系法杂交小麦等一系列新品种相继研究成功。
我国农作物育种出现了前所未有的辉煌局面。
许多人都感慨地说：“在杂交水稻处于迷茫或转折时期，袁隆平总能够提出正确的思路，让同行们茅塞顿开，眼前豁然开朗。为什么总会出现这样的状况？”
袁隆平的秘书辛业芸说：“这就是袁先生的胆识过人之处。面对困难，袁先生毫不退缩，总是善于抓住关键，凭借丰富的实践经验，为突破困难，做出理论设计，再到实践中寻求答案。从理论到实践，再到理论，再回到实践，直至获得成功，这就是袁先生成功的秘诀。”
袁隆平在事业获得成功的时候，丝毫也没有沾沾自喜，相反，他时时告诫自己，一定要谦虚谨慎。
选育超级杂交水稻
1985年，袁隆平从国际水稻研究所获悉，全世界面临“人口膨胀，耕地锐减，粮食紧缺”的严重危机。
当时，我国许多人被国内一时出现的“卖粮难”现象所迷惑，对于水稻高产的问题缺乏关注。
这时，袁隆平写出了《杂交水稻超高产育种探讨》一文。他大胆地指出：
我国是一个11亿人口的大国，粮食仍是我国十分严峻的问题。我国以占世界1／7的耕地，养活占世界1／5的人口，提高粮食产量仍然是摆在中国人民面前的首要任务。
目前，杂交稻虽然已应用于生产，但还有广阔的发展前景，还蕴藏着巨大的增产潜力……