腐败是每一个朝代都存在的毒瘤，它不断地腐蚀着国家的肌体，动摇着家族统治的秩序。在历代皇帝中，明太祖是反腐最狠的一个，动不动就枭首剥皮。而雍正帝也不遑多让，被贪官们称为“抄家皇帝”。雍正的铁腕治腐，带来的是良好的吏治风气和民心的归附，巩固了爱新觉罗家族的统治。
康熙在位时间长达61年。在他统治后期，作为一个老皇帝，康熙十分欣赏汉文帝施惠于民、尽量不扰民的统治方针。于是，像一般的老人一样，晚年的康熙不免有要利泽天下，以求博得为政宽仁美名的想法。
但社会的发展不容于个人的美好想法，一味地宽容，对社会并没有多大的好处。相反，在此指引下，康熙末年的社会积弊十分多：
社会吏治日益松弛，官吏贪污成风；在不借白不借的心理支配之下，政府高官们、皇子们大肆从国库中借支，造成国家钱粮空虚，国库告急；地方绅衿鱼肉百姓，贫者愈贫，富者愈富。从战略角度考虑，按照康熙末年的财政状况，如若国家再有大灾难，或者是边疆告急引发战争的话，那么国家财政必然捉襟见肘，国库空虚到无银用兵赈灾的地步。用雍正的话来形容，那就是“关系非浅”了，后果十分严重。
“新官上任三把火”。雍正上台伊始，第一招就是向吏治开刀，实在是因为吏治腐败是康熙晚年最大的弊政之一，而清查亏空正是整顿吏治的最好突破口。雍正像全国大小官吏那么多，对于新君还十分陌生。雍正除了隆科多、年羹尧等几个可信任的人之外，无所依靠，正好可以通过清查亏空这场运动，撒下大网，借势观人，激浊扬清，杀一儆百。也就是说，通过这场运动，可以光明正大地打击异己势力，树立威权。正如前述，康熙末年的储位之争十分激烈，雍正的登基即位又是诡秘难辨，以致人心不服，基础不稳。雍正发动清查，正可以借机名正言顺地打击诸王的朋党势力，巩固自己的地位和权力。
清查亏空的第三个好处是有助于摸清家底，真正掌握财政状况。雍正是励精图治之主，想干的事情很多，青海正在打仗，异己还没有铲除，但干大事要花大钱。只有摸清家底，改善财政，才能身上有钱，心里不慌。
雍正尽管未必懂得“从数字上管理国家”的道理，但他知道“一旦地方有事，急需开支，拿什么去应付”的道理。明主治吏不治民，从贪官污吏身上要钱，不但不会引起民怨，还能博得好名声。这样来看，清查亏空这一着，真乃“一举三得”之良策。
雍正在清查亏空的过程当中，不时派遣特派员来解决一些棘手问题。特派官员异地清查亏空情况，让他们互相监督，这是雍正惯于使用的一着狠棋，十分灵验。
雍正五年，福建布政使沈延玉报告说，福建省的仓谷出现亏空。雍正认为一定是巡抚毛文铨瞒上欺下所导致，马上特派广东巡抚杨文乾和许容为钦差大臣前往清查。
上次清查江西钱粮，雍正调动了大批的候补官员，让他们时刻准备上岗。这次清查福建的仓谷亏空，与候补官员调动同时进行的，是舆论的准备。
雍正发布上谕告诫福建的老百姓：因为清查马上就要进行，有些贪官们可能已听到风声，会临时借调有钱人家的粮食来充实库存。如果你们有人把粮食出借给他们的话，那出借的粮食就成了官府所有了，发觉后也不再归还。
上谕还说：我已经挑选了一批候补府州县官员随同钦差一起到福建，如果“现任府州县内之钱粮稍有不清者，即令更换”。把候补官员摆在那里，查出问题马上换人。这种破釜沉舟的姿态，表明了雍正彻底清查的决心。
地方的清查亏空责任到总督巡抚，时限三年，已如前述。中央北京乃盘根错节之地，清查工作就更难展开，因此更应注重清查技巧，加大清查力度。
这样，雍正元年（公元1723年）年正月十四日，雍正下令设立了一个独立的清查机构——会考府，主要稽查核实中央各部院的钱粮奏销（就是各省每年将钱粮征收解拨的实数报部奏闻）工作。
本来，各部院的收入支出、钱粮运用，都是由各部院自行奏销，因此账目混乱，官员营私舞弊的现象十分多。
为了从制度上堵塞这个漏洞，雍正规定会考府负责稽查审计各部的收支。凡是钱粮的奏销，不管出自那个部门，都应该由新设立的会考府清厘“出入之数”，这样就把奏销大权由原先的各部院收归中央。这样一来，官员即使想做手脚也不容易了，政府也有希望能把奏销这个大洞补上。
为了提高会考府的权力，雍正委任他的兄弟怡亲王允祥、舅舅隆科多、大学士白潢、尚书朱轼等四人共同负责，并谕令允祥说：你如果不能清查，我会再派大臣；大臣再不能干，我会亲自出马。可见雍正决心很大。
会考府成立了两年多，办理了各部院奏销事件550余件，其中被驳回的就有96件，成效显著。清查中即使关系到贵族和高级官僚，也不宽贷。其实，这一次清查亏空的行动，一大批达官显贵、王公贵族被牵连进去。比如雍正的十二弟履郡王允祹因为曾主管过内务府事务，在追索亏空中被迫将家中的器物当街变卖。
让前任官僚们把口中的肉，包括已经是消化多年的肉重新吐出来，这在中国历史上恐怕少见。亏空一旦被清查出来，赃官就被革职拘禁。雍正迫使他们吐出赃银，保证如数归还国库，通常的手段之一就是严厉抄家。雍正元年八月，通政司右通政钱以锴提出一套查抄补追的方法，主要原则是：凡亏空官员被查验核实之后，一方面严格搜查原工作单位，一方面发文件到他原籍的地方官，命令当地查封其家产，控制其家人。而后再追索变卖财物，杜绝赃银有转移藏匿的可能。
此项建议马上得到了雍正的赞同，并明确表示：查没来的财产，将用于公事及查没中的有功人员。抄家之风使大小官员心惊肉跳，有人悄悄地送了雍正一个外号：抄家皇帝。把贪官及其家属“捆绑”起来查没，用株连的办法来对付贪官，这正是雍正为贪官们十分憎恨的理由，也是雍正惩治贪污成果显著的重要原因。
历史传说中雍正狠毒的骂名，大多由此而来。据说，当时官员们在一起打牌时，把其中的私牌也戏称为“抄家私”，可见雍正反腐败是雷厉风行的。