肉兔选配时应掌握以下几条原则：
（1）避免近交造成衰退是生物界的普遍规律。肉兔配种一定要避免近交。一般掌握在种兔生产5代之内没有血缘关系，商品兔生产3代以内无血缘关系。
（2）优配优。优秀母兔必须用优秀公兔配种，而且公兔的等级应高于母兔的等级。这就需要在配种之前对于所有的种兔进行品质鉴定。
（3）年龄选配。种兔群应以壮龄公兔（1～2岁）为骨干，老龄兔之间、青年兔之间、老龄兔和青年兔之间尽量不交配。
（4）效果不好不配。应定期总结繁殖效果，并对每只种兔（特别是种公兔）的繁殖成绩作出客观的评定，并选出最佳配合，查出最差配合。凡是配种效果不好的配合，下次不再结合，选择与上次的公兔血缘关系较远的种公兔交配。
（5）有遗传缺陷的不配。有明显遗传缺陷的肉兔不能参加配种，比如单睾、牛眼、八字形或“O”形腿、牙齿错位（巨齿獠牙）等。后代中产生遗传缺陷的个体，说明其双亲携带隐性有害基因，应予以淘汰。商品生产时，这样的公母兔不可再次结合。