在良种牦牛类群中心产区，建立核心群或良种牦牛场，有利于逐步带动产区千家万户，形成稳定的选育基地。
在核心群或良种场初建时，从产区牦牛群中认真评定和选购最优秀的牦牛50头以上。其标准应该是：血缘清楚，外貌基本符合选育方向或肉用型特征明显，产毛量高，经综合评级年龄3～6岁的种公牦牛应在一级（含一级）以上；4～5岁的种母牦牛应该在二级（含二级）以上，特级、一级要占70%以上。在牧户中选择品质较好的牛群组建一批选育群。核心群或良种场首先为选育群提供种畜、冻精或胚胎，选育群再向基地一般牛群提供种牛。
核心群必须建立种牛档案，也就是系谱，包括种公牛的来源、评定等级、精液品质和后代等级等；种母牛的评定等级、繁殖、生产性能等；以及幼牦牛出生登记、生长发育等记载。选育群可建立牛群档案或参配种公牦牛及二级以上母牦牛的卡片。
对核心牛群和选育群的牛只必须进行编号和标记，便于选育工作的开展。
（1）编号方法。牦牛犊出生后，应立即编号或起诨名。为避免重复，核心群、选育群应有一定数量的顺序号码。如核心群1～1000号，选育群1001～2000号，一般牛群为2001～3000号等。牛只出售、淘汰或死亡，不要以其他牛只替补其号码，购入的种公牦牛用原号，不要改号。
（2）标记方法。①带圆形耳标或长条耳环。在金属耳标上打上号码，再用耳标钳将耳号夹到牛耳上缘便于观察的部位，不要使耳标紧压牛耳的边缘，以免被压组织坏死使耳标脱落。②带塑料方牌。用不褪色笔将牛号写在方牌两面，系于颈拴系绳上，适用于系留管理的犊牛、母牛。③角部烙号。将特制的号码烙铁烧红后，在保定好的牦牛角上重压烙号，牦牛在2岁时在角上烙号为好，注意要烙得均匀不脱皮。