“生命诚可贵，爱情价更高。若为自由故，两者皆可抛。”——匈牙利·裴多菲
经过一番努力，拿破仑为法国赢得了和平，第二次反法同盟被打败。于是，他成为人民心中的英雄。现在，他开始考虑让国家安定下来的大政方针了，所以制定宗教信仰法就被提上了议事日程。
拿破仑认为，宗教问题并不就是一个主要宗教教派的问题，要全面实现国内的宗教和平，必须全面解决宗教问题。这样一来，国家才能有一个稳定的宗教环境。
在此之前，一派有势力的人曾向拿破仑倡议同教皇决裂，建立一个独立的法国天主教会，其首脑应住在法国。对方还指出，这样做可以使第一执政的权力大大增强。但是，拿破仑却不以为然，他说：
“我相信，法国一部分是要成为新教徒的，尤其是我要赞助那个倾向的话。我也确信，法国大部分仍将信仰天主教，他们会热情百倍地反对同胞分化。我只须恢复法国原来盛行的宗教，再给少数人以宗教信仰自由，就能使每个人满意了。”
拿破仑本人并不信仰任何宗教，但却深通心理战略。他十分清楚地认识到，教会仍能左右群众的情感。法国境内还有4万名僧侣，他们对人民的心理足以发挥强大的影响。为了使自己的政权获得强有力的支持，拿破仑决定与天主教合作。
1801年7月15日，拿破仑就重建天主教信仰一事，同新教皇庇护七世达成了政教协议。一个月后，《箴言报》发表了一项告示，措词如下：
“明天，热月27日，即8月15日（星期日）是圣母升天节，届时，巴黎圣母院教堂和各教区教堂都将举行感恩赞美诗歌诵会，以示广施恩德……”
人们不敢相信自己的眼睛。这些曾被革命风暴扫除的历史垃圾如今重又出现在法兰西共和国的官方报纸上，人们不由得感叹革命早已成为往事。1801年，法国正式恢复了天主教会后，接着拿破仑又着手去解决其他宗教问题了。
1802年，拿破仑颁布了新教组织条例，组织条例承认新教与天主教拥有同样的地位，承认法国两个主要新教组织略尔文教派和路德教派；允许他们自由选举牧师，并在长老法庭内管理自己的事务。新教牧师的薪俸也与天主教教士一样由国家发给。国家保留对牧师的批准权，但是，不准新教组织与任何外国发生联系。
新教的地位得到拿破仑政府的公开保护，拥有与天主教会同样的权利。这一切使法国的新教徒感到衷心的满意。
一个政权的稳固必须要争取最广大的人民的支持，尽可能扩大朋友，减少敌人。而一个多信仰的国家的团结，则依赖于宗教宽容政策。主张宗教信仰自由，将获得最为广泛的统治基础，而各个教派之间的和解和共处，将有利于国家的安定和建设新的社会。因此，颁布保护信仰自己的法律法规，就成为执政者最好的政治宣言。
拿破仑是一个聪明的政治领导人，他不信仰宗教，也不对宗教抱有任何幻想；但是，他却不敢忽视众多的宗教信徒，以及宗教对这些人的影响力。所以，根据现实的政治需要，拿破仑灵活变通，与天主教等教派合作，赢得了众多教徒的支持，扩大了自己的势力范围。