加强对温室花卉的栽培管理对于防治病虫害有一定的疗效。
（1）及时清除病虫害残体。及时摘除病枝，清除因病虫或其他原因致死的植株。园艺操作过程中应避免人为传染，如在切花、摘心、除草时要防止工具和人手对病菌的传带。除草要及时，许多杂草是病虫害的野生寄主（如酢浆草常常招致蜡虫危害），增加了病虫害的侵染来源，同时杂草丛生还提高了周围环境的湿度，有利于病害的发生。
（2）合理轮作。连作往往会加重温室花卉病害的发生。如香石竹多年连作时，会加重镰刀菌枯萎病的发生，实行轮作可以减轻病害。轮作是古老而有效的防病措施，轮作植物须为非寄主植物。通过轮作，使土壤中的病原物因找不到食物饥饿而死，从而降低病原物的数量。
（3）加强肥水管理。合理的肥水管理不仅能使花卉植物健壮地生长，而且能增强花卉植物抵御病虫的能力。使用无机肥时要注意氮、磷、钾等营养成分的配合，防止施肥过量或出现缺素症。根据不同种类的花卉品种和习性，科学配合施肥，调节花卉的生长势，增强抗病虫的能力，促进花卉的健壮生长。
（4）栽培营养。土要在种植前暴晒处理，或用五氯硝基苯等药剂处理土壤，以防携带病菌和虫卵。同时，施用腐熟的有机肥，既有利于提高根际周围微生物的抵抗作用，又有利于减轻枯萎病、猝倒病的发生。
（5）改善环境条件。改善环境条件主要是指调节温室的光照、温度及湿度。花卉生长期间，要经常清扫温室棚膜上的灰尘，保持棚膜清洁，同时要早揭晚盖草苫，延长光照时间，以减轻病害。
（6）加强温室等保护地栽培管理，降低病虫害发生。包括苗木或植物材料的挑选、剔除和修剪带有病虫的枝叶，介质及操作工具的消毒，水源的清洁，花木摆放密度，环境及地面的清理等，通过各种栽培措施，能使有害生物种类减少50％～71.4％。高畦栽培，可以采用喷灌进行灌溉，过道覆盖农作物秸秆，可降低温室相对湿度，提高通风透光性能，减少发病的几率。