（1）真菌病害。真菌性病害是花卉病害中最主要的一类。真菌是没有叶绿素的低等植物，肉眼看不见。它不能自造养分，以菌丝体在花卉体内吸收养料。真菌孢子借风、雨、昆虫等四处传播。
常见花卉真菌性病害有：①白粉病。病菌附生在芽蕾和嫩叶上，出现白色霉层，被害叶和梢卷曲萎缩、畸形，花蕾不能正常开放，病菌孢子随气流传播蔓延，昼夜温差在10℃时最易大面积发作，温室内最易蔓延。如月季、倒挂金钟、梅花、凤仙花、瓜叶菊、大丽花白粉病等。②黑斑病。此病为花卉常见病害，病害在土壤中潜伏，随雨水溅落侵入下部叶片，迅速向上蔓延。被害叶片先出现黑色斑点，逐渐扩大成圆形、椭圆形接连成片。病叶萎黄、凋落，对花卉生长影响大。通常在7～8月雨季发病较迅猛。常见的有月季、菊花、牡丹、天竺葵黑斑病等。③黑锈病。病菌孢子侵染，开始叶片正面出现苍白色小斑点，逐渐膨大呈稍圆形突起，背面表皮破裂生出橙黄色粉末，随风飞散，大面积侵染。随后，在叶片上生暗墨色椭圆斑点，叶背表皮破裂后，又生出黑色粉末。严重时，自下而上全株染病，叶片焦枯，提早脱落。常见的有玫瑰、鸢尾、蔷薇黑锈病等。④幼苗立枯病。由镰刀菌、丝核菌和腐霉引起的幼苗病害，表现症状为腐烂、猝倒、立枯等，以幼苗出土20天内受害最重。常见的有唐菖蒲、百合、海棠、香石竹立枯病等。⑤炭疽病。主要危害叶片，也可危害茎部。一种是在叶片上长出淡褐色或灰白色而边缘则呈紫褐色或暗褐色的近圆形斑点。此斑点常发生于叶缘或叶尖，其上有黑色小点，即病菌分生孢子盘。严重时使大半叶片枯黑。如兰草炭疽病，也常见于白兰、橡皮树、仙客来、绣球等花卉上。另一种是在茎上产生圆形或近圆形的病斑，呈淡褐色，其上生黑色小点。⑥煤烟病。危害多种花木的枝叶和果实。病原为多种真菌。它们多以蚜虫或介壳虫作为传播的媒介。初期时表面出现暗褐色霉斑，逐渐扩大形成黑色煤烟状霉层，阻碍植株的光合作用，使植株无法制造养分而枯萎死亡。⑦溃疡病。发病时，叶片上出现圆形赤褐色斑点，枝条呈淡色，久病后叶落。施肥过多，枝叶徒长，容易引起此病。一旦发病，可以喷洒0.4％～0.2％硫酸亚铁溶液或波尔多液，应注意合理施肥，加强通风透气。⑧白绢病。此病发生时，在植株的茎部基部或根部出现白色绢丝状菌丝，叶片自下而上逐渐枯萎，甚至全部枯死。气温过高、空气过潮、土壤渍水，易得此病。应改善温湿状况、控制浇水，隔离病株，用石灰粉可防此病。
（2）细菌病害。细菌是一种很小的单细胞生物，没有营养体和繁殖的分化，通过细胞膜摄取养分，以分裂方式进行繁殖。细菌侵染主要通过气孔、密腺、伤口等途径，一般借流水、风雨、昆虫、土壤以及病株残余体等来传播。常见的细菌病害有月季、榆叶梅的根癌病和柑橘的溃疡病等。
（3）病毒病害。病毒是一种极微小的寄生物，用电子显微镜才能看见，病毒只在活的花卉细胞内繁殖。病毒通过昆虫（主要是刺吸式口器昆虫，如蚜虫、红蜘蛛等）、嫁接、机械损伤等途径传播。病状有花叶、黄化、卷叶、畸形、丛矮、坏死、斑点等。常见的有月季、海棠的花叶病和锈果病等。