（1）饲料。饲料是畜禽赖以生长的最基本的食物。自然状态下，畜禽可根据自身营养需要和适口性进行食物选择，在规模饲养的情况下，则要根据动物不同生长发育阶段的需要进行饲料配制，因此饲料的品质与安全性直接影响动物生产性能的表现及机体的健康水平。优质安全的饲料，能够促进动物生产性能的充分发挥，达到最佳健康养殖状态；而劣质饲料（发霉变质）或有害成分超量（重金属含量）的饲料，会阻碍动物的生长发育，甚至导致动物中毒而死亡。当人们食用这类动物食品后，生命健康也会受到影响。
（2）药物及添加剂。在养殖畜禽的生产活动中，还存在药物及添加剂使用的误区：如动物预防性投药阶段，还使用国家禁止的药物；肉鸡全程养殖使用抗球虫药；为增加动物产品色泽，饲料中添加着色剂；使用促生长和提高饲料转化率的药物等。养殖户应按照相关规定和标准科学使用药物和添加剂，才能做到安全养殖。
（3）养殖环境。随着动物养殖规模的扩大，动物排泄物中含有大量有机物，包括氮、磷、铜、砷等有害物质。这些有害物质一方面造成土壤污染、植物中毒和水质恶化，另一方面增加了氨、硫化氢等臭气的浓度，污染人类和动物生活的环境，从而容易诱发人和动物疾病，直接和间接危害人类健康。
（4）动物疫病。病害不仅会对畜禽产生影响，当人食用带有病菌的畜禽产品后，会引发各种疾病传播，给人类安全带来严重威胁。