（1）提供营养。堆肥不仅含有氮、磷、钾、钙、镁、硫等常量营养成分，还禽有铁、锰、铜、锌等微量元素。堆肥与化学肥料有很大的区别，即其肥效是缓效性，连续使用时可产生累积效果。堆肥中的有机物在土壤中慢慢分解而放出养分，在前期耕作期间未能分解而残留的有机物，在后期耕作或翌年继续分解供给养分，因此未分解的有机物可累积在土壤中为作物提供营养。
（2）改善土壤化学性质。增加土壤有机质，调节土壤pH值，增强土壤中阳离子交换能量，加强土壤螯合作用，改善土壤缓冲能力。
（3）改善土壤物理性质。改善土壤结构，保持土壤水分，涵养土壤氧气，防止土壤冲蚀，增强土壤强度。
（4）丰富土壤生物群落。由于有机堆肥含有丰富和复杂的成分，长期施用于耕作的农田中，可以丰富土壤生物群落，也使生物群落趋向稳定，进而促进土壤中物质循环和能量循环。某些阻碍作物生长的有害物质也较易被分解去除。另外，可以增强生物群落的缓冲能力，防止有害生物（病菌、害虫）的突发增殖。