放苗前的药物消毒是指对即将放苗的池子用药物进行消毒，杀灭池中的病原体和敌害生物。
（1）鳝苗池药物消毒时间为鳝苗入池前7～10天进行。如果用药后时间过短，即用药过迟，往往因药物毒性未完全消失而出现鳝苗进池中毒现象；如果用药时间过早，会因药性消失苗池又滋生致病生物和敌害生物。
（2）清池消毒的药物有生石灰、漂白粉等，生产上多用生石灰进行清池消毒。因为生石灰不仅使用方便，而且价格也优惠，更重要的是清池消毒较为彻底，杀灭病原体和敌害生物效果优于其他药物，能杀死细菌、寄生虫、水生昆虫、野杂鱼、螺蛳和蚂蟥等。
（3）药物清池应选择在晴天进行，如果在阴雨天用药，不但操作不方便，更重要的是影响用药效果。用生石灰消毒的方法是：先把池内过多的水排出，只留5～10厘米深的水，然后将生石灰投入池水中，或装入有水的木桶等器皿内，生石灰遇水发生化学反应，产生强碱性的氢氧化钙和大量热量。待池中或器皿中的生石灰形成生灰浆后，趁热将生灰浆泼洒全池，不要留有死角。生石灰的用量为每平方米0.1～0.15千克，漂白粉用量为每平方米20～22克。