其实，人类联邦与四个二流顶级文明从联合到决裂，再到对抗是必然的，玉玲珑之死不过是诱因。
原因很简单，三个一流顶级文明相继消亡之后，人类联邦与四个二流顶级文明成为了矛盾的两个对立面。虽然人类联邦的实力不足以跟四个二流顶级文明抗衡，但是人类联邦所采取的不合作态度，特别是玉玲珑在世期间所采取的对抗措施，对四个二流顶级文明推广新的统治秩序构成了巨大威胁。哪怕玉玲珑十分的理智，没有通过跟其他文明结盟跟四个二流顶级文明抗衡，可是只要人类联邦没向四个二流顶级文明妥协，就必然会有越来越多的文明团结在人类联邦的身边。只要有充足的时间，那么以人类联邦为核心的文明集团就必然对四个二流顶级文明构成严重的威胁。因为人类联邦已经足够强大，所以加上其他文明必然是一股不可小觑的力量。
从这个角度来看，就算玉玲珑还活着，人类联邦也会跟四个二流顶级文明决裂。
正是如此，玉家一直认为是四个二流顶级文明暗杀了玉玲珑，其中兵域族与狂兽族的嫌疑最大。数百年来，玉家一直在追查此事，只是没有找到任何可靠的线索，甚至连一点有价值的发现都谈不上。
其实，决裂只是开始，对抗的开始。
仁慧女王还在的时候，极境族起到了缓冲作用。可以说，只要极境族不愿意发动针对人类联邦的战争，其他三个二流顶级文明就不敢贸然采取行动。很简单，极境族拥有最强大的综合实力。
可惜的是，仁慧女王也没有活多久。
仁慧女王之后，再也没有任何人能够阻止战争爆发。
首先向人类联邦发动战争的不是兵域族，也不是狂兽族，而是昆阳族。其实，那是一次偶然事件。
当时，在四个二流顶级文明中，兵域族与狂兽族的态度最为坚决，一直主张对人类联邦发动战争。由仁慧女王统治的极境族偏向于跟人类联邦和平相处，而且仁慧女王为此做出了巨大努力。虽然新登基的女王没有保持仁慧女王坚持的和平路线，但是在对待战争的态度上比较暧昧，并非积极的主战派。相对而言，昆阳族的态度一直很模糊，基本上可以说是保持中立。也正是如此，在仁慧女王之后，昆阳族的洛商王成为了新的调解人，积极在各个文明之间奔走。
在仁慧女王去世后的第七年，洛商王应人类联邦的要求访问家园星系，并且准备在此跟人类联邦签署一份具有重大价值的非官方协议，即承认人类联邦在北部大区的特权，也就是玉玲珑维护的核心利益，而人类联邦也将做出妥协，让雷凌族、织星族与隐灵族的难民接受昆阳族主导的身份核查，只有符合要求的难民才能留在人类联邦提供的避难所，其他的则转移到中心大区，一个由昆阳族提供的恒星系。当然，洛商王将以个人身份为这些难民提供基本的安全保证。
虽然这只是一份非官方协议，但是在正式签署之后，人类联邦与四个二流顶级文明的矛盾，至少是表面矛盾将彻底消除。哪怕主要的矛盾没有得到解决，但是兵域族与狂兽族将失去发动战争的理由。有了这份协议，只要洛商王还是昆阳族的统治者，人类与四个二流顶级文明的和平就有了保证。
只是，洛商王没能顺利的到达家园星系。
在前往家园星系的路上，洛商王的飞船遭到袭击。虽然他没有步仁慧女王的后尘，幸运的逃过了一劫，还在不久之后会到昆阳族的母星，但是与人类联邦的协议成为了泡影。随后昆阳族就宣称，袭击洛商王的是一支获得了人类联邦暗中支持的海盗，而且发动袭击的目的就是要除掉洛商王。
这下，人类联邦与昆阳族的矛盾被激化了。
没有等到人类联邦做出正式回应，也没有做进一步的调查，洛商王就代表昆阳族向人类联邦宣战。
随后，兵域族与狂兽族也向人类联邦宣战。
虽然极境族并没有在第一时间向人类联邦宣战，但是也在不久之后，即人类联邦迫于战争威胁开始加强外围防御部署，并且在内部展开了战争动员之后，加入了这场战争，正式对人类联邦宣战。
此后，南阿尔法星系里的其他文明也陆续卷入这场战争。当然，大部分文明加入了四个二流顶级文明的阵营，向人类联邦宣战，只有少数几个跟人类联邦关系密切的文明选择跟人类联邦并肩作战。这其中，包括由人类联邦帮助实现重建的独门族，以及在杨屹离开之后依靠分散在其他文明的子民复国的梅森族。
可惜的是，这是一场实力相差极为悬殊的战争。
在战争全面爆发，也就是极境族向人类联邦宣战的时候，人类联邦只是勉强控制了整个北部大区，核心区域仍然是北四区，而那些后来选择跟人类联邦结盟的文明，也主要分布在北部大区里面。即便把整个北部大区都算上，人类联邦控制的区域只相当于南阿尔法星系的五分之一，拥有的资源更只有南阿尔法星系的十分之一。如果以恒星系力量适合碳基生物生存的星球，以及这些星球的容纳能力为标准，那么人类联邦控制的生存空间还不到南阿尔法星系的二十分之一。此外，在决定战争潜力的最为重要的因素，即人口规模上，人类联邦与所有盟友只相当于对手的百分之一。
可以说，不管怎么看，人类联邦都处于绝对的劣势。
从某种意义上讲，双方的实力差距之大，远远超过了之前的三次战争，即隐灵族与雷凌族，隐灵族跟织星族，以及四个二流顶级文明对付隐灵族与织星族的战争。如果把双方掌握的科技实力也算进去，那么人类联邦别说跟四个二流顶级文明比，即便跟其中的任何一个比都处于绝对下风。
也正是如此，大部分文明才选择投靠四个二流顶级文明，而不是跟人类联邦结盟。
只不过，这场战争并没有一面倒。
不是说四个二流顶级文明小看了人类联邦，也不是说其战争准备不够充分，而是人类联邦早就有所防备。
事实上，玉玲珑在世的时候，人类联邦就在为战争做准备。
虽然玉玲珑一直在竭力维持跟四个二流顶级文明的关系，努力避免战争，但是她比谁都清楚，除非放弃核心利益，不然人类联邦与四个二流顶级文明的战争将不可避免，而放弃核心利益显然不可能。为此，早在银河系联盟瓦解的时候，玉玲珑就开始为战争做准备，只不大多密而不宣。
更重要的是，人类联邦一直实行全民皆兵的基本政策，所有公民在成年之后都必须无条件的服兵役，哪怕接受了高等教育，也要在毕业之后补上。至于其他领域，人类联邦更多的是依靠那些关系密切的盟友，比如独门族与梅森族。简单的说，人类联邦的核心力量就是强大的军团与舰队。为了保证军事建设能够顺利进行，人类联邦甚至在某些次要利益上向结盟的文明妥协，甚至跟结盟的文明形成伴生关系。比如第一产业全部移交给了独门族，由独门族负责从农业生产到环境维护的所有基础工作。又比如在科研领域，人类联邦给予了梅森族同等的地位，将包括核心军事技术在内的科学技术无条件的向梅森族开放，并且让梅森族的科学家参与了所有科研工作。再比如充分利用了三个一流顶级文明的难民，培养出了三支分别由雷凌人、织星人与隐灵人为主的精锐部队。当然，人类联邦还充分吸取与借鉴了其他文明在军事领域的精华，比如向雷凌族学习防御作战的战术，通过织星族掌握了很多用于进攻的战术，从隐灵族那里获得了搜集与处理情报的技术。总而言之，只要能提高人类联邦的军事实力，就可以采用。
到战争爆发的时候，人类联邦拥有南阿尔法星系中综合实力最为强大的军事力量。
此外，人类联邦还拥有当时整个南阿尔法星系中最完善的防御体系。其实，这也是人类联邦在控制了北部大区之后，依然以北四区为中心，没有盲目的向外扩张的关键所在，即人类联邦在北部大区的扩张主要是为了扩大防御纵深，拉开北四区，特别是家园星系与其他文明核心区域的距离。也正是如此，任何来自南面的敌人得首先攻占外围恒星系，然后向前推进差不多两千光年才能到达家园星系附近。哪怕敌人很强大，兵力没半点问题，维持两千光年的补给线也是个巨大挑战。
正是凭借这些本钱，人类联邦才有资格向四个二流顶级文明叫板。
也正是依靠这些前期做的准备，人类联邦顶住了四个二流顶级文明的第一轮猛攻，成功的将速决战演变成了消耗战。只是，人类联邦并没能反败为胜，也一直没有获得反败为胜的机会。很简单，在面对由四个二流顶级文明统帅的上万个文明的围攻之下，人类联邦最多也只能做到自保，准确说是尽可能的让战败来得晚一点。事实上，这是由玉玲珑为人类联邦定下的基本战略。所有的一切以争取时间为主，因为只有一个能能拯救人类联邦，而玉玲珑到死都相信，这个人会在将来某一天回来。在他回来后，人类联邦将无敌于这个宇宙，再不用惧怕任何敌人。
这个人，就是杨屹。