矿物质的代谢可以通过分析血液、头发、尿液或组织中的浓度来判断。在人体内矿物质的作用相互关联。在合适的浓度范围有益于人和动、植物的健康，缺乏或过多都能致病，而疾病又影响其代谢，往往增加其消耗量。在我国，钙、铁和碘的缺乏较常见。硒、氟等随地域环境的不同，可有缺乏病，如克山病和大骨节病、龋齿等，矿物质在体内的吸收和分布都不会有任何化学结构的改变。矿物质的摄入量过多可能会产生毒性，因此如果机体对这类物质毫无选择的吸收也会造成危害，如氟骨症和硒中毒。
