南大洋有相当丰富的浮游生物，但鱼的种类却很少。南大洋大部分地区的水深都在4000～5000米之间，但与其他大洋不同，这里并没有密集的深水鱼群。另外，南极大陆架窄而且深，不大适合鱼类生长。所以，在世界上已经发现的20000多种海洋鱼类中，在南大洋里只有100多种，其中真正有经济价值的只有20种。
1970年，商业性船队开始在南大洋作业，主要捕捞鳕鱼、冰鱼等。其中，苏联船队在南乔治亚水域的捕获量是41.7万吨。但在以后的几年里捕获量却很少，说明这一地区的鱼类已经被捕捞得差不多了。后来，苏联、民主德国和波兰又重新增加了对南极鱼的捕获，1977年这3个国家公布的总捕获量是27.9万吨。苏联人还对蓝百鱼很感兴趣，1979～1980年夏季的捕获量是2.3万吨。另外，法国、澳大利亚、联邦德国、日本、阿根廷和新西兰等国对南大洋里的渔业资源都很感兴趣。
南大洋与世界上其他大洋不同的是，在这里似乎没有密集的表层鱼群，而绝大部分具有经济价值的种类都为底栖类。南极鲱鱼、鳕鱼和南极齿鱼被认为是商业潜力最大的南极鱼类。应该指出的是，南极鱼类资源虽然也是一种可再生的资源，但由于其繁殖力较弱，生长速度缓慢，如果过度捕捞，很容易遭到灭种的危险。
此外，南大洋的乌贼也是一种具有潜在开发价值的生物资源，但目前还没有进行开发。因为枪乌贼只在夜间浮到水面，而且游动速度很快，捕捞比较困难。已发现南大洋的枪乌贼个头较大，数量可观。最大者体长5米，重达184千克。估计枪乌贼的可捕量达1700万吨。如果能进行捕捞，并适当加工，它也是一种较为重要的动物蛋白来源。
南大洋的鱼类主要分布在南极辐合带以南的某些水域，特别是岛屿附近海域，更为丰富。波兰、阿根廷、巴西和乌拉圭等国家也曾先后进行过捕捞。商业性渔场主要集中在南大西洋、南印度洋和某些岛屿周围海区，如南乔治亚及克尔盖伦海区等，捕获量约40万～60万吨。此外，根据鲸、海豹和鸟类每年消耗的鱼类量估算，南大洋中鱼类的年产量约1500万吨。
由于南极鱼类的生长速度慢，个头小，产量低，所以极易使其资源因过度捕捞而遭受破坏，甚至使某些海域资源枯竭。如南乔治亚海区，过去鱼类资源相当丰富，经过几年连续捕捞后，使其资源仅剩20％。因此，国际社会已对该海区和克尔盖伦海区采取了保护措施，以解决局部海区鱼类资源急剧下降的问题。
虽然，目前一般认为，南大洋中鱼类的开发价值没有磷虾和鲸等生物资源那么大，但是，随着对南极海洋生物资源调查的不断深入，南极鱼类的生活习性和数量分布会逐步明确，其潜在的价值也将显示出来。