急性肾盂肾炎初起多属实证，慢性肾盂肾炎急性发作则多属虚中夹实证，非急性发作则可以是虚证，也可以是虚中夹实证（如兼夹湿热未尽、气血瘀滞等）。
实证多有明显的小便频数、量少涩痛，为湿热蕴结膀胱所致。如湿热弥漫三焦，而且寒热往来者，可根据辨证予蒿芩清胆汤、三仁汤、大柴胡汤等加减治之；如无寒热，可用八正散以清利膀胱湿热；如属肝经湿热下注膀胱，可用龙胆泻肝汤治之；如热伤血络而见血尿者，亦属中医的血淋，一般清利膀胱湿热则血可自止，如未止可酌加丹皮、茅根、琥珀粉，或用小蓟饮子以清热凉血；如少腹胀痛或坠胀明显，则属中医的气淋，一般可于清利湿热中加香附、乌药、青皮，或用沉香散；如瘀血停滞，排尿刺痛，可在清利湿热中加桃仁、红花、牛膝、王不留行。实证通过祛邪的治疗，往往可使菌尿转阴。
虚中夹实证属邪多虚少者（如慢性肾盂肾炎的急性发作期），清利湿热的八正散、龙胆泻肝汤之类可酌情临时用之，但不要伤正；邪少虚多者（如慢性肾盂肾炎的非急性发作阶段，但有尿流不畅，少腹疼痛等症状者），宜滋肾清利，方如知柏地黄汤、猪苓汤加减，如兼气虚乏力可加党参、黄芪；腰酸痛可加桑寄生、杜仲、牛膝；尿液混浊可加萆、滑石；尿道刺痛可加牛膝、王不留行、通草；少腹胀痛可加乌药、没药等。如有心火移热小肠而尿血者，可用导赤清心汤（时逸人老中医经验方：由鲜生地、麦冬、玄参、沙参、丹皮、竹叶、莲子心、茯苓、益元散、灯芯、通草等组成），能使血尿迅速消失。虚中夹实证易反复发作，当属中医的劳淋，在虚中夹实证的治疗中，通过扶正祛邪，有的病人也可使菌尿转阴。
对于虚证患者来说，属肝肾阴虚者，可用六味地黄汤合二至丸；属肺脾气虚者可用补中益气汤、保元汤；属气阴两虚者，可用参芪地黄汤、大补元煎；属肾阳不足者，可用金匮肾气汤。